SEQGENE.

Multi-Platform-Tool zum Mining-Datensätzen der nächsten Generation
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SEQGENE. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Xutao Deng
  • Betriebssysteme:
  • Windows XP / Vista / XP X64 / Vista64 / 7 / 7 x64
  • Dateigröße:
  • 203 MB

SEQGENE. Stichworte


SEQGENE. Beschreibung

SEQGENE ist eingebaut, um eine Open-Source-Anwendung zu sein, die das Hauptziel auf das wichtigste Ziel von NEXT-Gen-Sequenzierungsdatensätzen hat. Das Programm soll sich auch auf die Qualitätskontrolle von Nach-Alignment, SNP und Indel-Identifikation und Annotation, RNA-Expressionsquantifizierung, Allelspezifische Ausdruck und Expression-Genoting-Assoziationsanalyse konzentrieren. SEQGENE eignet sich besonders für RNA-SEQ- und Exonome-SEQ-Anwendungen mit Fokus auf Protein-Codierung und Regulierungsregionen eines Genoms. Bei RNA-SEQ-Anwendungen hat SEQGENe eine neuartige topologische Pathway-Analyse-Methode implementiert, um SNP-Expression-Co-Anreicherungen und SNP-Expression-Pfade zu identifizieren.


SEQGENE. Zugehörige Software