Pypedal manipulieren Sie Ihre Stammbäume mit dieser Anwendung
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Pypedal Ranking & Zusammenfassung

Pypedal Stichworte

Manipulator Manipulation Stammbaum

Pypedal Beschreibung

Pypedal ist als Python-Modul konzipiert, das Instrumente für die Manipulation von Pedigrees bereitstellt. Die zur Verfügung gestellten Instrumente können auch eine einfache Visualisierung von Pedigrees und die Berechnung von Maßnahmen der genetischen Vielfalt von Pedigrees anbieten. Haupteigenschaften: Lesen von Pedigree-Dateien in benutzerdefinierten Formaten Pedigree-Integrität prüfen (doppelte IDs, Eltern jünger als Nachwuchs usw.) Erzeugen von zusammenfassenden Informationen wie Häufigkeit des Erscheinungsfrequenz in der Pedigree-Datei Neuordnung und Neuumfrage von Pedigree-Dateien Berechnung der Numerator-Beziehung Matrix (A) aus einer Pedigree-Datei mit der tabellarischen Methode Inzuchtberechnungen für große Pedigrees Berechnung der durchschnittlichen Gesamt- und Durchschnittskoeffizienten von Inzucht und Beziehung Berechnung von Koeffizienten von Teil inzucht mit einer iterativen tabellarischen Methode (LAYATION, 1996; Gulisija, 2006) Berechnung von Koeffizienten von Ahnen inzucht mit den Methoden von Ballou (1997) oder Suwanlee et al. (2007) Berechnung der theoretischen und tatsächlichen effektiven Bevölkerungsgrößen Berechnung der effektiven Gründernummer mit dem genauen Algorithmus von Lacy Berechnung der effektiven Gründernummer mit dem ungefähren Algorithmus von BOICHARD et al. Berechnung der effektiven Vorfahrennummer mit den Algorithmen von Boichard et al. Auswahl von Subpedigrees, die alle Vorfahren eines Tieres enthalten Identifizierung der gemeinsamen Verwandten von zwei Tieren Berechnung der Inzucht von Nachwuchs von einer potenziellen Paarung Ausgang an ASCII-Textdateien, einschließlich Matrizen, Inzucht von Inzucht und Beziehung und Zusammenfassungsinformationen Importierung und Exportierung von GEDCOM 5.5-Dateien Importierung und Exportierung von Genen 1.20 (dbase iii) Dateien Laden von Pestigrees von, und speichern Sie sie an, MySQL, Postgres- und SQLite-Datenbanken Simulation von Pedigrees mit einem Algorithmus, der von der in MATVEC 1.1A abgeleitet ist

Pypedal Zugehörige Software