Pgdspider Datenkonvertierungsanwendung zum Anschließen von Populationsgenetik und Genomics-Programmen
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Pgdspider Ranking & Zusammenfassung

Pgdspider Stichworte

Genom Population Genetik Populationsgenetik

Pgdspider Beschreibung

PGDSPIDER wurde mit der Java-Programmiersprache als Konvertierungs-App für Bevölkerungsgenetik und Genomics-Programme erstellt. Die Software erleichtert die Datenaustauschmöglichkeiten zwischen Programmen für einen umfangreichen Bereich von Datentypen (z. B. DNA, RNA, NGS, MicroSATELLITE, SNP, RFN, AFLP, Multilelic-Daten, Allelfrequenz oder genetische Entfernungen). Neben den herkömmlichen Genetikformaten der Bevölkerung integriert PGDSPider Populationsgenomikdatenformate, die üblicherweise zum Speichern und Handeln von Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) verwendet werden. Derzeit soll PGDSPIDER nicht sehr große NGS-Dateien so konvertieren, dass sie die gesamte Eingabedatei in den Speicher in den Speicher in den Speicher umwandeln soll, deren Größe den RAM überschreiten kann. Da PGDSPider jedoch ermöglicht, bestimmte Teilmengen dieser NGS-Dateien in jedes andere Format umzusetzen, kann man diese Funktion verwenden, um Parameter oder Statistiken für bestimmte Bereiche zu berechnen, und führen somit die Gleitfensteranalyse über große genomische Regionen durch.

Pgdspider Zugehörige Software