Modelltest Ein Werkzeug, um das beste Modell der Nukleotidersubstitution auszuwählen
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Modelltest Ranking & Zusammenfassung

Modelltest Stichworte

URL-Ersetzung Auswahl Textinsubstitution. Auswechslung Nukleotid-Anteil Trichview-Substitution. Substitutions-Chiffre Shift-Substitutions-Chiffriert Nukleotidsequenz Nukleotidsequenzmanager Nukleotide Teilsubstitution. Antriebsubstitution monoalphabetische Substitution. Nukleotid-Substitutionsmodell Nukleotidmotiv Komplexes Substitutionsmodell Nukleotidersubstitution. Modellauswahl Framework. hierarchische Wahrscheinlichkeit Nukleotidannotation. DNA-Substitutionsmodell Nukleotidausrichtungen. Substitution DNA-Modell. Synonyme Substitution. Nichtsnoundonyme Substitution. Substitutionsmodell Nukleotid-Polymorphismen. Nukleotidmutation. Nukleotidfraktion

Modelltest Beschreibung

ModelTest ist eine fortschrittliche und zuverlässige Software, die entwickelt wurde, um Genetik-Ingenieure bei der Bestimmung der Unterschiede zwischen DNA-Substitutionsmodellen unter Verwendung hierarchischer Hypothesenprüfung zu dienen, um die Ergebnisse zu erzeugen. Befehlszeilenschnittstelle Der Antrag ist ziemlich komplex, da es für erfahrene Benutzer mit einem soliden Hintergrundkenntnissen in Genetik sowie Computer gedacht ist, insbesondere, da es den Benutzern keine GUI liefert, die nur über die Befehlszeilenschnittstelle läuft, die sie recht herausfordern kann Für Anfänger. Dennoch erfordert der ModellTest keine Installation, daher genügt es, dass Benutzer die ausführbare Datei einfach auf eine offene Instanz der Eingabeaufforderung geben und die ENTER-Taste drücken, die wiederum die Programmfunktionen des Programms mit einer kurzen Erläuterung der verfügbaren Befehle erhebt. Funktionen und Ausführen von Parametern ModelTest soll mit den von PAUP * erzeugten Dateien arbeiten, die die erforderlichen Genetik-Informationen sowie Dateien enthalten, die mit Parameterschätzungen für die bewerteten Modelle RAW-Protokollwerten umfassen. Am entgegengesetzten Ende erzeugt das Dienstprogramm eine Beschreibung der geleisteten Wahrscheinlichkeitsverhältnis-Tests, und ihre entsprechenden p-Werte, Informationen, die dann ein ordnungsgemäßes Modell interpretiert und zugewiesen werden. Die unterstützten Modelle sind in der Befehlszeilenschnittstelle aufgeführt, einschließlich JC (Jukes und Cantor), TRNEF (Tamura-Nein mit gleichen Basisfrequenzen), Tim (Übergangsmodell), GTR (allgemeiner Time Reversible), F81 (Felsenstein) und mehrere weitere . Gleichzeitig können Benutzer mit einem bestimmten Satz von Funktionen zusammenarbeiten, das im Hauptfenster beispielhaft dargestellt ist, um sie leichter zu verstehen und zu beschäftigen. Daher können Benutzer den Debug-Level (-D), den Alpha-Level (-A), die Anzahl der Taxa (-t), ermitteln, den LRT-Rechnermodus (-L) aktivieren, das Vertrauensintervall für die Mittelung (-W) bestimmen. oder verwenden Sie BIC anstelle von AIC für alle zukünftigen Operationen (-B). ein umfassendes Instrument zur Bestimmung des richtigen Substitutionsmodells Zum Abschluss ist ModelTest eine effiziente Anwendung, die für Fachleute entwickelt wurde, die auf dem Gebiet der Genetik tätig ist, und bietet ihnen die Möglichkeit, DNA-Substitutionsmodelle zu vergleichen, wodurch die Benutzer entscheiden, welchen Personen entscheiden, worauf Sie ihre Daten am besten passen.

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