Kurzer Sequenzort-Mapper

ein Programm, das geschrieben wurde, um den Standort von kurzen Sequenzen auf einer größeren Reihenfolge zu analysieren und zu visualisieren
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Kurzer Sequenzort-Mapper Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Bas Pigmans
  • Dateigröße:
  • 11.8 MB

Kurzer Sequenzort-Mapper Stichworte


Kurzer Sequenzort-Mapper Beschreibung

Kurzer Sequenzort-Mapper lädt die Sequenzen, richtet sie an und schließlich können Grafiken und Tabellen gleichzeitig für eine oder mehrere Datensätze erzeugt werden. SSLM arbeitet typischerweise mit einer BLAST-Datenausgabedatei von kurzen Solexa-Reads, die auf RNA-Probanden zugeordnet sind (z. B. Pre-Mirna-Sequenzen). Die Analyse kann entweder auf einer Sequenz in der Datenmenge oder auf verschiedenen RNA-Typen durchgeführt werden. Der generierte Ausgang ist auf dem Bildschirm oder in der TAB-separat-, fasta-, text- oder tiff-format. SSLM führt die BLAST-Suche nicht aus, um die kurzen Sequenzen zu verknüpfen, um dort eine größere Sequenz zu verknüpfen, von denen sie stammen. Nehmen Sie einen kurzen Sequenzort-Mapper für eine Probefahrt, um zu sehen, worum es geht!


Kurzer Sequenzort-Mapper Zugehörige Software