Icplquant. Quantifizierung von ICPL-markierten Peptiden mit diesem Werkzeug.
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Icplquant. Ranking & Zusammenfassung

Icplquant. Stichworte

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Icplquant. Beschreibung

Icplquant ist eine neue Software-Suite, die speziell entwickelt wurde, um ICPL-markierte Peptide auf dem MS-Niveau während der LC-MALDI- und Peptid-Massenfingerabdruckversuche genau zu quantifizieren. Ein großer Engpass in quantitativer Proteomik bleibt die Verfügbarkeit für leistungsstarke Software, um die Rohdaten automatisch auszuwerten. Im Falle der ICPPL-Quadruplex-Technologie ist es notwendig, die Quadruplets (ICPL0, ICPL4, ICPL6 und ICPL10-Label) im MS-Modus zu erkennen. Der zweite Schritt ist die Bestimmung der Verhältnisse der vier Vierbrettpeptide. In einem dritten Schritt muss mindestens eines der vier Peptide in jedem Quadruplet für MS / MS zur Sequenzidentifikation ausgewählt werden. Haupteigenschaften: Quantifizierung aller Multiplätze, die für isotopische Verunreinigungen von Reagenzien korrigieren. Vorbereitung einer Vorläuferliste mit Peptiden mit benutzerdefinierten Regulierungsfaktoren für MS / MS-Analyse. Maskottchen .Dat Dateiparser Zusammenführen von Quantifizierungsinformationen und Identifikationsinformationen Protein- und Peptidausgabelisten in offenen Formaten, leicht zugänglich für Data Mining-Programme Visuelle Anzeige von LC-Profilen Berechnung der Protein-Quantitions-Verhältnisse (mit Standardabweichungsschätzung) Export von Ergebnissen in Dateien, Excel und in Datenbanken Weitere Unterstützung in der Gehen: Hersteller Thermoelektronen / Finnigan; Orbitrap; Softwarepaket Xcalibur (.raw-Datei)

Icplquant. Zugehörige Software