Kompass

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Kompass Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Giuseppe Maccari
  • Betriebssysteme:
  • Windows NT / 2K / XP / Vista / 7
  • Dateigröße:
  • 1 MB

Kompass Stichworte


Kompass Beschreibung

Kompass (komplexes Muster der Sequenzsuchsoftware) ist ein einfaches und effektives Werkzeug, das den Bergbau ganzer Genom für das Vorhandensein komplexer Elemente ermöglicht. Das Tool ist benutzerfreundlich, flexibel, nicht ressourcenintensiv und in der Lage, ganze Genome in Minuten zu stöbern. Kompass wendet den bekannten Wu-Manber-Multiple-Muster-Matching-Algorithmus an, um das Motiv in der gesamten SE-QUEENCE erschöpfend zu suchen. Eingangselemente können einfache konservierte Sequenzen (wie in den Blast-Motor), teilweise oder hochgezeigte Sequenzen oder sogar mehrere degenerierte Sequenzen sein, verbunden durch schlecht konservierte Abstandhalter mit variabler Länge. Diese kleine Anwendung liefert die folgenden Sucharten: DAS, NCBI (Datenbank) oder Charge.


Kompass Zugehörige Software

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