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Famd Beschreibung

Die Studien von DNA-Fingerabdruck (AFLP, RAPD, ISSRS usw.) bringt von ihnen von Natur aus, unabhängig davon, ob das Geräusch, das mit der Technik verbunden ist, oder Fehler, die bei der Bewertung usw. Sie können Ihre Daten mit Abwesenheit / Anwesenheit (0/1) punkten. Das bedeutet, dass Sie versuchen, Datenpunkte zu trennen, über die Sie sich unsicher in Abwesenheiten und Zubehör (konservativ, wahrscheinlich Abwesenheiten und nicht anwesend sind). Alternativ können Sie Unsicherheiten ermöglichen: (0 /? / 1). Auf diese Weise können Sie später einen zweiten Blick auf Ihre Daten haben und fragen, welche Auswirkungen diese mehrdeutigen oder fehlenden Daten auf Ihre Analyse haben können. FAMD ist eine kleine, einfach zu bedienende Anwendung, die speziell entwickelt wurde, um Ihnen dabei zu helfen. FunD-Implementierung der fehlenden (oder mehrdeutigen) Daten, die das Folgende spezifisch annimmt: · Mindest- / Maximum / durchschnittliche (DIS) Ähnlichkeitsberechnung ermöglichen, dass die Schätzung des Umfangs, in den fehlenden Daten die Analyse auswirken können. · Jaccards, Würfel, SMC Ähnlichkeiten, Neili und euklidische Entfernungen · Ausgabe von Distanzmatrizen · Fehlende Daten wiederherstellen · Schätzung des Index von Shannon durch Bootstrapping. · UPGMA, NJ, strikte und Mehrheits-Regelkonsensbäume · Abschätzung der R-Unterstützung · POA (Hauptkoordinatenanalyse) und 3D-Viewer mit Bitmap- und Metadafile-Unterstützung · AMOVA für alle implementierten (DIS) Ähnlichkeitsmaßnahmen · Export von Daten auf eine Reihe von Formaten wie Nexus, Arlequin-Projekt, Hindex, Hickory (Nexus-Allele-Block), Genex, NTSYPC, Struktur, Hindex. · Bayesische Abschätzung der Bevölkerung NULL-Allelfrequenz und Berechnung der Bevölkerungsdistanzen.

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