FASTA-Dateivergleicher.

vergleicht Proteinsequenzen aus verschiedenen Fasta-Dateien
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FASTA-Dateivergleicher. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Name des Herausgebers:
  • Pacific Northwest National Laboratory
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 174 KB

FASTA-Dateivergleicher. Stichworte


FASTA-Dateivergleicher. Beschreibung

FASTA-Dateivergleicher ist ein nützliches Dienstprogramm, mit dem Teile der Proteinsequenzen von zwei FASTA-Dateien verglichen und die passenden Proteine und -sequenzen in eine Ausgabetextdatei schreiben. Der Benutzer muss die Länge der Rückstände angeben, die beim Vergleich der beiden Protein-Dateien verwendet werden soll. Die Ausgabedatei enthält die Namen der Proteine mit gemeinsamen Resten, den tatsächlichen Restresten, und die Proteinbeschreibungen für jedes Protein (wie aus der Fasta-Datei gelesen). Die Funktionalität dieses Programms ist eine vereinfachte Version des Strahlalgorithmus, in der die Proteine identische Aminosäuregionen (anstelle ähnlicher Homologie) haben müssen, die die Absicht von Blast ist).


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