| Venn Mapper. ein Programm, das heterologe Microarray-Datensätze vergleicht, basierend auf der Anzahl der üblichen, differentiall ... |
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Venn Mapper. Ranking & Zusammenfassung
- Name des Herausgebers:
- Marcel Smid
Venn Mapper. Stichworte
Venn Mapper. Beschreibung
Die Anwendung lädt Microarray-Daten (Genexpressions-Verhältnisse) und bestimmt, welche Gene durch ein benutzerdefiniertes Verhältnis-Abgrenzungsniveau auf- oder nachgerechnet sind. Für jedes Experiment werden Listen unterschiedlicher exprimierter Gene berechnet. Jede Liste wird mit jeder anderen Liste verglichen, und die Anzahl der co-auftretenden Gene wird berechnet. Mit der Verwendung der Binomialverteilung können der Überlappung, die zwischen zwei Listen enthalten ist, so genannte Z-Werte zugewiesen werden. Unterschiedliche Ausgabedateien werden vom Venn Mapper, der Berichterstattung erzeugt: (1) die Anzahl der auf- und heruntergeregelten Gene pro Array und in den Vergleiche (2) der Z-Werte und (3) der Gen-IDs. Holen Sie sich Venn Mapper und versuche es, seine Fähigkeiten vollständig zu bewerten!
Venn Mapper. Zugehörige Software