TFM-Explorer. Transkriptionsfaktor Matrix Explorer
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TFM-Explorer. Ranking & Zusammenfassung

TFM-Explorer. Stichworte

Analyse Glühbirne. Genom Genomanalyse Genom-Explorer.

TFM-Explorer. Beschreibung

TFM-Explorer ist ein Programm zur Analyse der regulatorischen Regionen eukaryotischer Genome. Es erfordert eine Reihe von corgestülierten Gensequenzen, und suchen Sie nach lokal überrepräsentierten Transkriptionsfaktor-Fachrichten. Der Algorithmus verläuft in zwei Schritten: · Scans-Sequenzen zum Erkennen aller potenzieller Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen mit Gewichtsmatrizen von JASPAR oder Transfac · Extrahiert erhebliche Cluster (Region der mit einem Faktor verbundenen Eingabsequenzen), indem eine Score-Funktion berechnet wird Der TFM-Explorer ermöglicht es auch, die Ergebniscluster und deren putativen Transkriptionsfaktor-Ausfallstellen auf den Eingabesequenzen zu visualisieren und nach cis-regulatorischen Modulen zu suchen. Holen Sie sich TFM-Explorer und verleihen Sie es, um zu sehen, was es tatsächlich für Sie tun kann!

TFM-Explorer. Zugehörige Software