Stecken Kürzester Triplett-Clustering
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Algorithmus Glühbirne.

Stecken Beschreibung

Der Name STC steht für kürzeste Triplett-Clustering. Wir schlagen ein neues distanzbasiertes Clustering-Verfahren, einen Triplett-Clustering-Algorithmus (STC) vor, um Phylogenies zu rekonstruieren. Die Hauptidee ist die Einführung einer natürlichen Definition von sogenannten k-repräsentativen Sets. Basierend auf k-repräsentativen Sets werden kürzeste Drillinge rekonstruiert und dienen als Bausteine für den STC-Algorithmus an Agglomerat-Sequenzen für die Tree-Rekonstruktion in O (n ^ 2) für N-Sequenzen. Simulationen mit 500, 1000 und 5000-Sequenzen-Datensätzen zeigen, dass STC eine bessere topologische Genauigkeit ergibt als andere getestete Methoden.

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