Mchenza Erkennen Sie dominante Marker mit dieser Java-App
Jetzt downloaden

Mchenza Ranking & Zusammenfassung

Mchenza Stichworte

Werkbank Marker

Mchenza Beschreibung

Die Mchenza wurde als zugängliche und open Source-Auswahlerkennung Workbench für dominante Marker entwickelt. Das Verständnis des Beitrags der Auswahl und der molekularen Anpassung bei der Formgebung der GENOM-Variation hat viele Anwendungen, die von der menschlichen Gesundheit bis zur Erhaltung von gefährdeten Arten reichen. Mcheza bietet eine integrierte Plattform, um dominante Marker zur Auswahl zu testen. Die Anwendung verbindet den DFDIST-Kernel, eine weit verbreitete FST-Ausreißermethode, um die Auswahl mit einer intelligenten, einfach zu verwendenden Schnittstelle zu erkennen. Haupteigenschaften: DFDIST - Der Kern von MCHEZA ist eine dominierende Version einer weit verbreiteten FST-Ausreißermethode, um die Auswahl zu erkennen. Unterstützung für eine mehrsteste Korrektur basierend auf falschen Entdeckungsraten (FDR). Multitste Korrektur ist grundlegend, um eine hohe Überschätzung des Prozentsatzes der Ausreißer zu vermeiden. Java Web Start-Anwendung mit einer einfach zu verwendenden Benutzeroberfläche, direkt aus dem Web verwendbar. Datenimport in GenePop-Format. Datenexport in R- oder allgemein verwendete Tabellenkalkulationssoftware. Fähigkeit, auszuwählen, welche Populationen und / oder Loci untersucht werden. Annäherung durchschnittliche neutrale FST durch Entfernen von potenziellen ausgewählten Loci. Annäherung durchschnittlich simulierte FST auf den durchschnittlichen Wert, der auf dem echten Datensatz gefunden wurde, selbst wenn die experimentellen Bedingungen weit von denjenigen, in denen die theoretische Formel weit entfernt sind (z. B. geringe Anzahl von Deme oder der Verwendung des schrittweisen Mutationsmodells). iterative Glättung der Vertrauensintervallkonturen. Generierung von Publikation Qualitätsgrafiken in mehreren Formaten (PNG, SVG und PDF) Fähigkeit, mehrere CPU-Kerne beim Laufen von DFDIST zu verwenden.

Mchenza Zugehörige Software