Jtreeview ist ein praktisches, einfach zu bedienendes Tool, mit dem Sie Baumdateien anzeigen können. Dieser Viewer ist auf Newick-Format (oder das benutzerdefinierte Speichern-Format, basierend auf Newick) beschränkt. Bäume können entweder als verwurzelte oder unrootierte, neu gestaltete, neu gestaltete und jedes Knoten- und Blattknotennamen mit regulären Ausdruckssuchen (roter Punkt in der verwurzelten Baum) hervorgehoben werden. Ein interessantes Merkmal ist die Fähigkeit, eine Sequenzausrichtung zu laden, die die in dem Baum vorhandenen Sequenzen enthält. Dadurch kann der Benutzer einen Teilbaum (Zweig) auswählen und die Ausrichtung der in nur diesem Zweig vorhandenen Sequenzen untersuchen.
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