DNA-DracheDNA-Sequenz-Contig-Assembler-Software | |
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DNA-Drache Ranking & Zusammenfassung
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DNA-Drache Stichworte
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DNA-Drache Beschreibung
DNA Drachen ist eine erweiterte DNA-Dienstprogramm, das mehr als 100000 Proben aus Sequenzformate verarbeiten kann (FASTA, EMBL, GenBank, etc.), Spurendateiformate (SCF, ABI, AB1) und der nächsten Generation Sequenzierungsdateiformate (Illumina, SFF, GFF , etc). Hinweis : Der Versuch aktiviert werden, kann die Lizenz-Taste in der Software. Haupteigenschaften: Liest die beliebtesten Sequenzformate:. (FASTA, GenBank, EMBL, SCF, ABI, AB1, SSF, Next Generation) Mehr Funktionen Trimmen. Vektor, Qualität und Ablängen Schnellmontagemaschine Griff Projekte mit mehr als 100.000 Sequenzen. Unterstützte Dateiformate: Projektdateien: XML DNA Drachen XML-Projekt (* .xml) Sequenzdateiformate: EMBL (* .EB; *. EBI; *. EMBL) GenBank (* .D; * gen; *. GenBank;. *. Txt) FASTA (* .FA; fas *; *. Schnell;. * FASTA;. * Fs; *. Fsa;.. * FSTA) Next Generation Sequencing Dateiformate: ABI SOLiD-Dateien (* .gff) SOLiD CSFASTA-Dateien (* .csfasta) Solexa Compact ASCII lesen Format, SCHAL (s _ * _ sequence.txt) Illumina _seq.txt Dateien (* .txt) Illumina fastq-Dateien (* .fastq) Illumina Qseq-Dateien (* _qseq.txt) 454 Standard flowgram-Dateien (* .sff) Alignment-Dateiformate: Sequenz Alignment / Karte (SAM) Format (* .sam) Binary Ausrichtung Format (* .bam) (* .bam) Trace-Dateiformate: SCF (* .scf) ABI (* .abi; *. Ab1) Navigator Baum: Eine Probe Navigator Baum macht die Projektstruktur (Contigs und Proben) sehr deutlich. Von hier aus den Proben ausgewählt sind, dann getrimmt und montiert. Trimmen und Trimmungen Funktionen: Primer-Clipping Vektor-Ausschnitt mit automatischer pseudocircularization (50 Basen). Sie können in den Sequenzen ohne Vorwissen mutmaßliche Vektor Motive erkennen. Sequenz qualitätsbasierten Trimmen Länge Trimmen Untimming. Wiederherstellungen eingeklipst Ende Montagemaschine und Contig Editor: Verschiedene Optionen die Montageparameter zur Verfügung stehen zu ändern. Die schnelle, indexbasierte Anordnung von Sequenzen mit automatischer Sortierung der Sequenzen innerhalb der Contigs (Offset- und trim Enden) macht das Projektmanagement ein Vergnügen. Die Korrekturlesen der Contigs (Sequenz-Alignment), das heißt Vergleich von Basen mit ihren Spuren und den Export / Kopie der Consensus-Sequenzen ist fast selbsterklärend.
DNA-Drache Zugehörige Software
Fastml
ein Programm zum Berechnen der Ahnen-Aminosäuresequenzen eines phylogenetischen Baums ...
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