Molekel

Eine kostenlose und offene molekulare Visualisierungsanwendung für Ihren Mac
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Molekel Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Swiss National Supercomputing Centre
  • Website des Verlags:
  • http://www.cscs.ch/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 31.9 MB

Molekel Stichworte


Molekel Beschreibung

Eine freien und Open-Source-molekulare Visualisierungsanwendung für Ihren Mac Molekel ist ein Open Source, einfach zu bedienen und kostenlos Multi-Plattform-molekulares Visualisierungsprogramm. Hier sind einige der wichtigsten Features von Molekel: · Lesen molekularen Daten aus verschiedenen Dateiformaten · Anzeige Moleküle mit verschiedenen Stilen: Spacefill, Ball und Schläger, Ball und Draht, Stock, Backbone (Rückstände), Band (Rückstände), Schematic (Rückstand) · Änderung Atom und Bindung Größe · Lesen Atom Farben aus der Datei · Anzeige Dipolmoment (für molekulare Formate diese Informationen enthalten) · Animate Atome, die die Flugbahn und Schwingungsinformationen in einigen Dateiformaten · Animate Moleküle lesen von Multi-Frame-PDB und xyz-Dateien · Anzeige Pfeile, um die Geschwindigkeit und Richtung der Bewegung jedes animierte Atom zu zeigen, · Animieren Moleküloberflächen (beim Exportieren amimation) · Entfernung und Führen (Dieder) Winkelberechnungen · Eine planare Sonde zum Verwenden Skalarfelder (z.B. elektrostatische Potential) zu visualisieren und den Wert des Skalarfeldes im 3D-Raum zu einem bestimmten Zeitpunkt angezeigt werden soll. · Visualize molecular orbital Isoflächen mit elektrostatischer Potentiale wahlweise farbcodiert. · Visualisieren von Dichtematrix wahlweise farbcodiert mit elektrostatischem Potential Mantelflächen. · Visualize Oberflächen von Rasterdaten (in Gaussian Würfel Format oder lesen von ADF tape41 Dateien) wahlweise farbcodiert mit elektrostatischem Potential. · Glätten von Rasterdaten (Gaussian .cube) mit Laplace-Glättungs erzeugten Oberflächen · Verwenden grid Datenlese- .cube von Dateien als molekulare elektrostatische Potential auf SAS und SES Oberflächen abzubilden · Compute Lösungsmittel zugängliche Oberfläche als Isofläche wahlweise farbcodiert mit elektrostatischem Potential. · Berechnen und Anzeige Solvent Ausgeschlossen Oberfläche, gegebenenfalls unter Verwendung M. F. Sanner des MSMS Programm (sehr empfehlenswert), erhalten sie hier · Export-Molekül zu einer Reihe von molekularen Dateiformaten · Export zu POV (Experimentell, durch Openbabel zu derem) · Export zu TIFF, PNG, PostScript- und PDF · Programmierbare Shader (GLSL) Unterstützung · Visualisierung von Strahlungsspektren (Infrarot- und Raman) · Hochwertige Multipass mit Anti-Aliasing und die korrekte Wiedergabe der mehrschichtigen transparenten Oberflächen Rendering · Eine Kombination von Schwingungsmoden Was ist neu in dieser Version: · Zusätzliche Unterstützung für die Tiefe für die korrekte Wiedergabe von transparenten Objekten Peeling; erfordert eine 2.0-Karte OpenGL und möglicherweise nicht ordnungsgemäß auf einigen Systemen arbeiten. Tiefe Peeling Parameter Rendering-Geschwindigkeit / Qualität transparenter Objekte beeinflussen können über das Dialog Display-> Ansichtseigenschaften eingestellt werden. · Added Plot von Infrarot- und Raman-Spektren mit PostScript- und PDF-Ausgabe · Integriert mit VTK 5.1 (cvs Version, da es keine offizielle Veröffentlichung noch ist) · Zusätzliche Unterstützung für Anti-Aliasing, standardmäßig deaktiviert; kann durch den Display-> Ansicht Eigenschaften-Dialog aktiviert werden. · Es ist jetzt möglich, Transparenz und Farben Orbital Oberflächen zu verändern. · Zusätzliche Unterstützung für persistente Einstellungen in Elektronendichteoberflächen Dialog. · Zusätzlicher neuer x-ray Shadern, dass die Arbeit richtig mit VTK 5.1. Behobene Fehler: · 392 - Add Unterstützung für Multi-Molekül Gamess Eingang · 401 - kann nicht gelöscht werden Connolly Oberfläche · 403 - Unterstützung der Befehlszeile · 404 - Fehler Molekiilorbital Daten Molden Lesen · 405 - Transparenz nicht konsistent für beide Orbital Farben (abhängig von der jeweiligen Karte / Treiber) · 406 - Animation läuft nach dem Molekül Löschen · 408 - Spiel Anfrage: Start Orbital Index von Null · 420 - Einstellungen nicht gespeichert, wenn Fenster zu schließen · 421 - Oberfläche von Rasterdaten: Abgelaufene Zeit Falscher · 422 - speichern kann nicht Animationen mit transparentem SES


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