pknotsrg.

RNA-Falt- und thermodynamisches Matching
Jetzt downloaden

pknotsrg. Ranking & Zusammenfassung

Anzeige

  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • pknotsRG Team
  • Website des Verlags:
  • http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/pknotsrg/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 359 KB

pknotsrg. Stichworte


pknotsrg. Beschreibung

RNA-Falt- und thermodynamisches Matching pknotsrg ist ein freies und einfach zu bedienendes Befehlszeilen-basiertes Werkzeug für faltende RNA-Sekundärstrukturen, einschließlich der Klasse der einfachen rekursiven Pseudoknots. Die Energieparameter für Strukturen, die keine Pseudoknots enthalten, sind die gleichen wie bei der tatsächlichen MFOLD 3.1. Die Energie für Pseudoknots wird mit einem Modell berechnet, das dem von Rivaseddy verwendete Rivaseddy in PNOTs ähnlich ist. Die Falttemperatur ist auf 37 ° C festgelegt. Die beste vollständige Struktur von s, die mindestens ein Pseudoknot irgendwo einschließt. · pknotsrg-loc: Liefert das beste lokale Pseudoknot, das Element einer beliebigen Struktur von S sein kann, wobei "am besten" durch freie Energie pro Nukleotid definiert ist. Der Rest von s bleibt entfaltet. Was ist neu in dieser Version: · Keine Müllkollektor-Bibliothek erforderlich · Interaktiver Modus · Unterstützung für FASTA-Dateieingaben · Neue Option -w: Schiebefenster · Neue Option --s: Ausgangsbreite für Strukturen


pknotsrg. Zugehörige Software

Furber

Ein Dolmetscher, der Anwendungen leitet, die in einer Sprache verfasst werden, die von der Norm IEC 61499 definiert ist ...

148 6 MB

Herunterladen

Über uns