 | mkESA.Verbessertes Suffix-Array-Bauwerkzeug |
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mkESA. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- GPL
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- mkESA Team
- Website des Verlags:
- http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/mkesa/
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
- Dateigröße:
- 295 KB
mkESA. Stichworte
mkESA. Beschreibung
Verbessertes Suffix-Array-Bauwerkzeug MKESA ist ein Open Source und ein kostenloses Programm zum Erstellen von verbesserten Suffix-Arrays (ESAs) aus biologischen Sequenzdaten. Das Programm basiert auf der Umsetzung des leichten tiefen Algorithmus von Manzinis, der auch mehrere CPUs / Kerne für zusätzliche Beschleunigen verwenden kann. Der generierte Ausgang ist kompatibel mit der Ausgabe von MKVTree aus dem von Stefan KURTZ geschriebenen VMatch-Paket.
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