UNIVERSAL System Biology Code Translation Tool
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UNIVERSAL Ranking & Zusammenfassung

UNIVERSAL Stichworte

Code Übersetzung Biologie

UNIVERSAL Beschreibung

Universal ist ein freies und open-Source-Client-Server-Java-Tool zum Erzeugen eines mathematischen Modellcodes aus einer Vielzahl von Eingabeformaten an einem von mehreren Ausgabeformaten. Beispielsweise werden die Eingabeformate, ein Komma getrennte Flat-Dateien von Universal gelesen und in einem SBML-Baum (SBML) -Baum (SBML) in Speicher auf dem Server konvertiert. Aus dem SBML-Baum wird der Modellcode in der C-Programming-Sprache (GSL, Sundials oder Octave C-Module) oder in MATLAB M-Code, Octave M-Code oder Scilab generiert. Da es außerdem erweiterbar ist, wurden eine Anzahl von Plugin-Modulen entwickelt, z. B. SBML zum Graphviz-DOT-Format für die Netzwerkvisualisierung. Universal umfasst sowohl eine grafische Benutzeroberfläche (GUI) als auch eine Codegenerierungsmotor (CGE). Die GUI ist in Objektiv-C / Cocoa geschrieben, während der CGE Java basiert.

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