Tracer

Tracer - kostenlose App zum Analysieren der von Bayesian MCMC-Läufen generierten Trace-Dateien
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Tracer Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Andrew Rambaut
  • Website des Verlags:
  • http://tree.bio.ed.ac.uk/software/seal/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 3.5 MB

Tracer Stichworte


Tracer Beschreibung

Tracer - Kostenlose App zum Analysieren der von Bayesian MCMC-Läufen generierten Trace-Dateien Tracer ist eine kostenlose App zum Analysieren der von Bayesian-MCMC-Läufen generierten Trace-Dateien (dh der von der Kette abgetasteten kontinuierlichen Parameterwerte). Es kann verwendet werden, um Läufe von MRBAYES, LAMARC, BEAST und möglicherweise anderen MCMC-Programmen zu analysieren. Es gibt 4 Analyse-Registerkarten zur Auswahl: · Schätzungen - Dies zeigt die mittlere, stdev-, Konfidenzintervalle und andere Statistiken zum ausgewählten Parameter. Eine Frequenzverteilung wird ebenfalls aufgetragen. · Dichte - Dies zeigt das Bayesian-Posteriordichtediagramm für den ausgewählten Parameter. · Joint-Marginal - Dies erscheint nur, wenn genau 2 Parameter ausgewählt werden (Halten Sie die Umschaltung, um mehrere Parameter auszuwählen). Es packt dann einen gegen den anderen, um ihre Gelenkgrenze-Verteilung anzusehen. · Trace - Dies zeigt die Spur des Parameters gegen die Zustands- oder Erzeugungsnummer. Verwenden Sie diese Option, um das Mischen zu überprüfen, wählen Sie ein geeignetes Einbrenne und suchen Sie nach Trends, die Probleme mit der Konvergenz vermuten lassen. Aquirements: · Java 1.5 oder höher


Tracer Zugehörige Software

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309 14.9 MB

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