Swiss-PDBViewer für Mac molekulare Visualisierungs-App: Analysieren Sie Proteine gleichzeitig.
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Swiss-PDBViewer für Mac Ranking & Zusammenfassung

Swiss-PDBViewer für Mac Stichworte

Swiss-PDBViewer für Mac Beschreibung

Swiss-PDBViewer (AKA DeepView) ist eine Anwendung, die eine benutzerfreundliche Schnittstelle bereitstellt, die die Analyse mehrerer Proteine gleichzeitig analysieren kann. Die Proteine können überlagert werden, um strukturelle Ausrichtungen abzuleiten und ihre aktiven Sites oder anderen relevanten Teilen zu vergleichen. Aminosäure-Mutationen, H-Bindungen, Winkel und Entfernungen zwischen Atomen sind dank der intuitiven Grafik- und Menüschnittstelle einfach zu erwerben. Swiss-PDBViewer (alias DeepView) wurde seit 1994 von Nicolas Guex entwickelt. Swiss-PDBViewer ist eng mit dem Swiss-Model verbunden, ein automatisierter Homologie-Modellierungsserver, der sich im Schweizerischen Institut für Bioinformatik (SIB) in der Bioinformatik-Gruppe im Biozentrum in Basel entwickelt hat. Arbeiten mit diesen beiden Programmen reduziert die Menge der Arbeit, die zum Generieren von Modellen erforderlich ist, da es möglich ist, eine Proteinprimärsequenz auf eine 3D-Vorlage zu fädeln und ein sofortiges Feedback zu erzielen, wie gut das Gewindeprotein von der Referenzstruktur angenommen wird, bevor die Anforderung zum Erstellen fehlender Schleifen eingereicht wird und verfeinern die Sidechain-Verpackung. Swiss-PDBViewer kann auch Elektronendichtekarten lesen und verschiedene Werkzeuge bereitstellen, um in die Dichte aufzubauen. Darüber hinaus sind verschiedene Modellierungswerkzeuge integriert und Befehlsdateien für populäre Energieminderungspakete können generiert werden. Schließlich können POV-Ray-Szenen aus der aktuellen Ansicht erzeugt werden, um umwerfend zu machen Ray-Traced-Qualitätsbilder.

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