Snapp SNP- und AFLP-Datenanalyse: Full Coalescent-Analyse ohne pesky-Genbäume.
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Snapp Ranking & Zusammenfassung

Snapp Stichworte

Baum Spezies

Snapp Beschreibung

SNAPP ist eine freie und open-Source-Implementierung einer MCMC-basierten Methode zum Inferrieren von Arten (Bevölkerung) Bäumen und Demografie von nicht verknüpften SNP-Daten. SNAPP (SNP- und AFLP-Paket für phylogenetische Analysen) ist ein Suite O-Werkzeuge für evolutionäre Inferenz aus molekularen Sequenzen. SNAPP verwendet ein komplexes und leistungsstarkes Eingabeformat (in XML angegeben), um das Evolutionärmodell zu beschreiben. Dies hat Vorteile in Bezug auf Flexibilität, da die Entwickler von SNAPP nicht jede Analyse ausprobieren müssen, die die Forscher möglicherweise ausführen möchten, und ausdrücklich eine Option für die Möglichkeit geben. Diese Flexibilität bedeutet jedoch, dass es möglich ist, Modelle zu erstellen, die unter dem verwendeten Inferenzrahmen von Markov Chain Monte Carlo (MCMC) nicht gut funktionieren. Snapp ist plattformübergreifend und es funktioniert auf Mac OS X, Windows und Linux. Binärdateien für Windows- und Linux-Plattformen finden Sie auf der Homepage des Projekts.Details Anweisungen zur Installation und Verwendung des SNAPP-Dienstprogramms auf Ihrem Mac sind hier verfügbar.

Snapp Zugehörige Software