Serienkloner bietet Werkzeuge mit einer intuitiven Schnittstelle, die Sie in der DNA-Klonierung, der Sequenzanalyse und der Visualisierung unterstützt
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Serienkloner Ranking & Zusammenfassung

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Klon dnd. Molekül Sequenzanalyse DNA-Klonen visualisieren DNA

Serienkloner Beschreibung

Bietet Tools mit einer intuitiven Schnittstelle, die Sie in der DNA-Klonierung, der Sequenzanalyse und der Visualisierung unterstützt Seriencloner ist eine Molekularbiologie-Software, die Tools mit einer intuitiven Schnittstelle bereitstellt, um Ihnen in der DNA-Klonierung, der Sequenzanalyse und der Visualisierung anzuwenden. Der Benutzer kann einen beliebigen Sequenzabschnitt annöschen oder den automatischen Scan verwenden, um gemeinsame Funktionen zu erkennen. Der serielle Kloner kann DNA-strider-kompatible Dateien lesen und schreiben und Dateien auch im FASTA-Format importieren oder exportieren. Ebenfalls neu in dieser Version ist die Möglichkeit, APE- und Vectornti-Dateien mit ihren Funktionen sowie PDRAW32-Sequenzen zu lesen. Genbank / EMBL-Dateien können auch im Internet mithilfe der mitgelieferten Weboberfläche importiert oder gelesen werden. Powerful grafische Anzeigewerkzeuge und einfache Schnittstellen helfen den Analyse- und Bauschritten auf sehr intuitive Weise. Alle Werkzeuge, die Sie analysieren und Ihre Sequenzen analysieren müssen, sind in einem All-in-One-Fenster-Konzept verfügbar. Alle Schlüsselfunktionen sind über eine kompakte Schnittstelle zugänglich. Ermöglicht das Erstellen von Textbeschränkungsmap und formatieren Sie es schnell, um eine Multi-Frame-Übersetzung hinzuzufügen oder nur zum Beispiel Einzelschneider anzuzeigen. Die Grafikkarte des seriellen Kloners ist wirklich grafisch, da Sie problemlos ein Merkmal, eine Fragment- oder Show-Single, Doppel- oder Mehrfachschneider in demselben Fenster auswählen und extrahieren können. Bei der Vorbereitung der elektronischen Versionen Ihrer Konstrukte. Neben den klassischen Restriktionskarten - sowohl grafische als auch textbasierte - oder Site-Nutzungsfenster können Sie schnell eine PCR-basierte Amplifikation einrichten oder synthetische Adapter vorbereiten. Srna-Konstruktionen, die auf vordefinierten Gerüsten basieren, sind ebenfalls automatisiert. Sie können Fragmente montieren, die durch PCR, Adapter / ShrNA-Synthese erhalten werden, oder einfach durch grafische Auswählen von Fragmenten zwischen Restriktionsstellen. Wählen Sie einfach, stumpf, wenn Sie benötigen, und klicken Sie auf die Ligate-Taste. Eine zusätzliche Schnittstelle ermöglicht das einfache Gateway-Klonen für BP- und LR-Reaktionen. Schließlich bietet serielle Kloner eine Schnittstelle, um zwei Sequenzen mit einem lokalen Algorithmus oder dem Blast2SEQ NCBI-Server auszurichten und einen Konsens ein virtueller Cutter, einen Webbrowser mit einem sofortigen Import von NCBI / EMBL-Einträgen und einen stillen Restriktions-Kartengenerator extrahieren. Um schnella-formatierte Text oder Dateien schnell vorbereiten, um eine Multi-Al-Ausrichtung-Anforderung an Clustal einzureichen. Was ist neu in dieser Version: · Serieller Kloner verarbeitet jetzt Merkmale / Anmerkungen. Funktionen können manuell oder durch Scannen hinzugefügt werden (siehe Balg). · Ein neues Bedienfeld im Sequenzfenster, um Funktionen / Anmerkungen zu verwalten · Eine Scan-Funktion (sowohl im Sequenzfenster als auch in der Symbolleiste verfügbar), um die Funktionen automatisch zu erkennen. Im Moment verwendet es eine interne Datenbank. Die nächste Version von Serial Cloner ermöglicht die Definition von Benutzerlisten. · Automatischer Scan direkt in der Grafikkarte verfügbar (verfügbar in der Symbolleiste oder aus dem Menü) · Fügen Sie eine Funktion nach der Auswahl eines Segments in der Grafikkarte hinzu. · Auswahl der Feature-Sequenz im Sequenzfenster, wenn Sie auf den Funktionsnamen in der Grafikkarte doppelklicken. · Montieren und speichern Sie eine Fasta-formatierte Multi-Sequenz, die alle aktuell geöffneten Sequenz enthält (nützlich für die Multi-Sequenz-Ausrichtung (z. B. Clustal-Einreichung)) · Montieren und kopieren Sie in die Zwischenablage einen Multi-Sequence-Fasta-formatierter Text, der alle aktuell geöffneten Sequenz enthält (nützlich für die Multi-Sequence-Ausrichtung (z. B. Clustal-Einreichung)) · Automatische Wiederherstellung von nicht gespeicherten Sequenzen in (hoffentlich seltener) Fall des Absturzes. · Scrollen in Sequenzen und Grafikkartenfenster mit Mausrad. · Benutzer kann die Breite des Grafikkartenfensters ändern · Die Größe des ausgewählten Fragments wird nun in der Grafikkarte angezeigt · Ziehen und positionieren Sie die Restriktionsstellen und den Merkmalamen in der Grafikkarte. · Serieller Kloner versucht jetzt, zu erraten, ob eine degenerierte Sequenzdatei geöffnet wird. · Importieren von Vektor-NTI-Sequenzen mit ihren Funktionen. · Importieren von APE-Sequenzen mit ihren Funktionen. · Import Genbanksequenzen (aus einer Datei) mit ihren Funktionen. · Für die Hauptfunktionen wurden mehrere Verknüpfungen hinzugefügt (Import, degenerierter Reihenfolge usw.) · Verwenden Sie ALT-Taste, um alternative Befehle aufzunehmen, die jetzt in der Symbolleiste verfügbar sind (neue degenerierte Sequenz, Import, interaktive Site-Nutzung). · Automatische Internet-Proxy-Erkennung mit den Systemeinstellungen (scheint nicht funktionieren, wenn eine .pAC-Datei unter MacOSX verwendet wird). · MacOSX: Ein Windows-Proxy (kleiner schwarzer Punkt, der im roten "Fenster" Fenster schließen "angezeigt wird) angezeigt wird, wird angezeigt, wenn die Sequenz modifiziert wurde und nicht gespeichert wurde. · Sequenznamen können direkt im Sequenzfenster geändert werden, indem Sie auf den Namen oder mit einem Kontextmenü mit einem Kontextmenü mit dem Strg-Clicking (oder mit der rechten Maustaste) auf den Sequenznamen doppelklicken. · Zusätzliche Parameter können im Präferenzfenster eingerichtet werden (Internet-Proxy-Management, Warnung beim Import von nicht seriellen Cloner-Dateien). · Erweitertes Kontextmenü im Grafikkartenfenster · Korrekte Sequenzformatanzeige, die im Sequenzfenster angezeigt wird, wenn Sie eine Sequenz in einer Genbank, EMBL, DDBJ, VNTI, PDBAW32 oder AFE öffnen. · Import von NCBI-Sequenzen mit dem Webzugriffsfenster (und der automatischen Parsing-Taste) wurde verbessert · Ausrichtung bei NCBI unter Verwendung der Blast 2-Sequenz-Software wird wiederhergestellt. · Verbessern Sie den Import von Sequenz, die fast, aber nicht vollständig, das Layout von NCBI-Sequenzen (mithilfe des Webzugriffsfensters) respektieren. · Ändern der Schnittstelle des Fensters, das verwendet wird, um die Verfügbarkeit einer neuen Version bekannt zu geben. · Handhabung bestimmter Typ IIS-Restriktionsenzyme wie xxxxx, -a, -b oder xxxxx, -a, + b. · Ein Absturz, der beim Ändern von CW / CCW ohne Auswahl ohne Auswahl in der Grafikkarte auftritt. · Ein Fehler beim PCR, wenn er auftritt, wenn er sehr lange Sequenzen verstärkt (mehr als 32 k) · MacOSX: Ein Fehler im Verhalten des Schubladenfensters des Fensters 'Verwalten von Restriktionsenzym'. · Ein Fehler in der Fragmentauswahl des Fensters 'Build a Construct'. · Ein seltener Fehler in der lokalen Ausrichtung, der einen Teil der ausgerichteten Ausgabe löschte · Ein Pop-Up-Windows wird nicht mehr angezeigt, was darauf hinweist, dass die Sequenz gesperrt wurde, wenn der Befehl 'speichern as.' verwendet wurde. · Die Berechnung der% des ausgerichteten Nukleotids im lokalen Ausrichtungsfenster wurde korrigiert. · Ein Fehler, der den seriellen Kloner verhindert, um Fasta-Dateien zu importieren, die akzentuierte Zeichen in der Kopfzeile enthalten. · MacOSX: Eine Schnittstellenfehler in den Schubladen des Sequenzfensters · Windows: Ein Problem mit 'FASTE-Befehlen' im Suchfenster. · Ein Fehler, der auftritt, wenn die DNA aus dem Übersetzungsfeld ausgewählt wird, wenn die DNA aus dem Minusstrang übersetzt wurde. · Ein Fehler, der entartete Restriktionsenzyme im Fenster 'Build a Construct' beeinflusst.

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