STREICH

Phylogeny-Aware Progressive Sequenzausrichtungsmethode
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STREICH Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • ari.loytynoja
  • Website des Verlags:
  • http://code.google.com/u/116870160609494076183/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X 10.7 or later
  • Dateigröße:
  • 310 KB

STREICH Stichworte


STREICH Beschreibung

Streich ist ein probabilistisches Mehrfachausrichtungsprogramm für DNA-, Codon- und Aminosäuresequenzen. Streich basiert auf einem neuen Algorithmus, der Insertionen korrekt behandelt und die Überschätzung der Anzahl der Löschereignisse vermeidet. Darüber hinaus lässt sich der Streich von Ideen aus maximaler Wahrscheinlichkeitsmethoden, die in Phylogenetics verwendet werden, und berücksichtigt die evolutionären Entfernungen zwischen den Sequenzen korrekt. Schließlich erlaubt Streich, eine mögliche Struktur für ausgerichtete Sequenzen zu definieren, und dann zwar gleichzeitig mit der Ausrichtung, prognostiziert die Standorte der Struktureinheiten in den Sequenzen.


STREICH Zugehörige Software