SNP-Score. -Programm für die Analyse von SNP und den möglichen Effekten auf die Verwendung von zwei verschiedenen Nukleotiden können auf der Bindung von Transkriptionsfaktoren auftreten
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SNP-Score. Ranking & Zusammenfassung

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SNP-Score. Beschreibung

Programm zur Analyse von SNP und den möglichen Auswirkungen auf zwei verschiedene Nukleotide können auf der Bindung von Transkriptionsfaktoren auftreten SNP-Score ist für die Analyse von SNP und die möglichen Wirkungen auf die Verwendung von zwei verschiedenen Nukleotiden auf der Bindung von Transkriptionsfaktoren. SNP-Score hat drei Portionen darin. Der erste Abschnitt erzielt die SNPs, die als input angegeben sind, punkten sie gegen ein Verzeichnis von Positionsfrequenzmatrizen in .pfm-Dateien, mit einem Ausgang des Top-5-Transkriptionsfaktors mit den größten Unterschieden in den Scores zwischen den beiden SNP-Allelen für jeden SNP. Der zweite Abschnitt ist der Homologie-Scoring-Abschnitt, der eine Datei von Homologiesequenzen als Input ergreift und dann die Transkriptionsfaktoren gegen die homologen Sequenzen erzielt. Es wird dann die Ergebnisse und Sequenzen des höchsten gefundenen höchsten in einem Tisch zusammen mit den menschlichen SNP-Sequenzen zum Vergleich ausgegeben. Der letzte Teil ist ein Ausrichtungsabschnitt, der in der SNP mit jeder möglichen Reihenfolge der Größe 40 dauert und eine Ausrichtung mit jeder Sequenz durchführt der Größe 40 in jeder Homologiesequenz. Die SNP-Score gibt dann die Informationen innerhalb derselben Tabelle wie oben aus. Was ist neu in dieser Version: · Optionen Redone, Jetzt Optionen und Befehlszeilenoptionen können miteinander verbunden werden. Split-Programm bis zu den Schnittstellen. · Erzeugte Schnittstelle für Input, Scoring und Info. · Integriertes Get_snp_info mit SNPScore, um die Dinge einfacher und intuitiver zu machen. · Inline-Eingabetyp hinzugefügt.

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