SEQ-Gen. SEQ-Gen - Anwendung, die die Entwicklung von Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen entlang einer Phylogene simuliert
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SEQ-Gen. Ranking & Zusammenfassung

SEQ-Gen. Stichworte

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SEQ-Gen. Beschreibung

SEQ-Gen - Anwendung, die die Entwicklung von Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen entlang einer Phylogene simuliert SEQ-Gen ist eine Anwendung, die die Entwicklung von Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen entlang einer Phylogene simuliert, wobei gemeinsame Modelle des Substitutionsvorgangs verwendet wird. Eine Reihe von Modellen der molekularen Evolution wird ebenfalls implementiert, einschließlich des allgemeinen reversiblen Modells.State-Frequenzen und andere Parameter des Modells können gegeben und die sortenspezifische Rate-Heterogenität auch auf verschiedene Weise eingebaut sein. Eine beliebige Anzahl von Bäumen kann eingelesen werden und das Programm erzeugt für jeden Baum eine beliebige Anzahl von Datensätzen. So können große Sätze von Replikationssimulationen einfach erstellt werden. Es wurde so konzipiert, dass es ein Allzwecksimulator ist, der die meisten der üblicherweise verwendeten (und rechendurchsetzbaren) Modelle der molekularen Sequenzentwicklung enthält.

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