Rnashapes.

Free Command Line-basierte RNA-Analyse-Tool
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Rnashapes. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • RNAshapes Team
  • Website des Verlags:
  • http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnashapes/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 1.4 MB

Rnashapes. Stichworte


Rnashapes. Beschreibung

Kostenloses Befehlszeilenbasis RNA-Analyse-Tool RNA-Form-Abstraktion Kartenstrukturen auf einen baumartigen Bereich von Formen, der Begrenzung und Verschachtelung von strukturellen Merkmalen, aber ignorieren von Helixlängen. Form Abstraktion integriert gut mit dynamischen Programmieralgorithmen und kann daher während der Strukturvorhersage statt anschließend angewendet werden. Dies vermeidet die exponentielle Explosion und kann uns noch ein nicht-heuristisches und vollständige Bericht über die Eigenschaften des Faltfläche des Moleküls geben. RNASHAPES bietet drei leistungsstarke RNA-Analyse-Tools in einem einzigen Softwarepaket: · Berechnung eines kleinen Satzes repräsentativer Strukturen unterschiedlicher Formen, vollständig in einem genau definierten Sinne. · Berechnung der angesammelten Formwahrscheinlichkeiten. · Die vergleichende Vorhersage von Konsensstrukturen als Alternative zu den übergreifenden SANKOFF-Algorithmus.RNASHAPES ist als C-Quellcode und kompilierte Binärdateien erhältlich und kann auf Mac verwendet werden OS X, UNIX- und Microsoft Windows-basierte Maschinen.


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