Reduzieren Kostenlose Anwendung zum Hinzufügen von Hydrogenen an eine Proteindatenbank (PDB) Molekularstrukturdatei
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Kostenlose Anwendung zum Hinzufügen von Hydrogenen an eine Proteindatenbank (PDB) Molekularstrukturdatei Reduzieren ist eine freie Anwendung zum Hinzufügen von Hydrogenen an eine Proteindatenbank (PDB) -Molekularstrukturdatei. Die Hydrogene werden in standardisierter Geometrie mit der Optimierung der Orientierungen von OH, NH3, SH, ASN, Methyls und Gln-Sidechain-Amiden und seinen Ringen versetzt. Die Proteine und Nukleinsäuren können verarbeitet werden. Het-Gruppen können auch verarbeitet werden, solange die Atomverbindung vorgesehen ist. Eine leicht modifizierte Version der vom PDB veröffentlichten Konnektivitätstabelle ist unten verfügbar. Beachten Sie, dass das Het-Wörterbuch in zwei "Aromen" erhältlich ist - neu und alt. Welcher zu verwenden ist abhängig von welcher Art von reduzierter PDB, die Sie als Ausgabe wünschen.

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