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RECCO. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Name des Herausgebers:
- Max-Planck-Institut Informatik
- Website des Verlags:
- http://methmarker.mpi-inf.mpg.de/
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
- Dateigröße:
- 1.6 MB
RECCO. Stichworte
RECCO. Beschreibung
Analysiert Ausrichtungen von Sequenzen, die sich mit Rekombination und Mutation entwickelt haben RECCO ist ein kostenloses Programm, das die Ausrichtung von Sequenzen analysiert, die sich mit Rekombination und Mutation entwickelt haben. Die Analyse liefert Beweise, ob ein Datensatz Rekombination enthält, in welcher Reihenfolge ein rekombinant ist und die Rekombinations-Haltepunkte sind. Die Analyse basiert auf der Erläuterung einer Sequenz mit allen anderen Sequenzen in der Ausrichtung unter Verwendung von Mutation und Rekombination. Eine parametrische Analyse des Parameters Alpha, die die Rekombinationskosten gegen Mutationskosten gewichtet, ergibt zusätzliche Informationen, in der sich die Reihenfolge rekombinant sein könnte.note: RECCO ist kostenlos für nicht kommerzielle Nutzung. Anforderungen: · Java 1.5 oder höher Was ist neu in dieser Version: · Mehrere kleinere Fehler behoben (mit GUI Repainting, Command Line-Verarbeitung unter anderem) · "Ansicht => Optimale Lösung nur" zeigt nur die optimalen Lösungen · "Opt SEQSEL" -Taste Entfernt Sequenzen aus der Ausrichtung, so dass Beweise für die Rekombination für die aktuell ausgewählte Reihenfolge maximiert werden · Befehlszeile geändert: Weitere Optionen, etwas anderes Syntax, Befehlszeilenbeschreibung jetzt korrekt. · Die Auswahl eines Aminosäure-Modells aus dem Menü funktioniert jetzt
RECCO. Zugehörige Software
