RDP-Klassifizierer. NAVE Bayesianer Klassifizierer, der schnell und genau taxonomische Aufträge von Domain an Gattung bietet
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RDP-Klassifizierer. Ranking & Zusammenfassung

RDP-Klassifizierer. Stichworte

Reihenfolge klassifizieren Klassifikator RNA-Sequenz klassifizieren Bakteriensequenz klassifizieren Archael-Sequenz klassifizieren

RDP-Klassifizierer. Beschreibung

Naiver Bayesian-Klassifizierer, der schnell und genau taxonomische Aufträge von Domain an Gattung bietet Der RDP-Klassifizierer ist ein naiver Bayesian-Klassifizierer, der entwickelt wurde, um eine rasche taxonomische Platzierung auf Basis von RRNA-Sequenzdaten bereitzustellen. Der RDP-Klassifizierer kann bakterielle 16s-RRNA-Sequenzen schnell und genau in die neue Taxonomie höherer Ordnung klassifizieren, die von Bergeys Vertrauen vorgeschlagen wird. Es bietet taxonomische Aufgaben von Domain an Gattung, mit Vertrauensschätzungen für jeden Auftrag. Der RDP-Klassifizierer ist nicht auf die Verwendung der von den Redakteuren des Bergeys vorgeschlagenen bakteriellen Taxonomie beschränkt. Es funktionierte ebenso gut, wenn er auf der NCBI-Taxonomie trainiert wurde. Der RDP-Klassifizierer kann wahrscheinlich an weitere phylogenetisch kohärente bakterielle Taxonomien angepasst werden. Der RDP-Klassifizierer ermöglicht es Ihnen, die neue phylogenetisch konsistente Bakterienstaxonomie, die von Garrity ET, leicht 16s-RRNA-Gensequenzen zuzuweisen. Al.Hierarchical Taxa basiert auf einem naiven Bayesien RRNA-Klassifizierer. Der neu ausgebildete Klassifizierer ermöglicht die Einstufung von Bakterien- und Archaeal-16s-RRNA-Sequenzen. Was ist neu in dieser Version: · Die vorherige Version würde Sequenzen ohne gültige Wörter klassifizieren. · Geändert, um neue Variable MIN_GOOD_Words zu erfordern, und legen Sie sie als Min_Seq_len-Sequence fest.

RDP-Klassifizierer. Zugehörige Software