Pyrx

Moleküldaten ansehen Mit diesem Werkzeug
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Pyrx Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • BSD
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Sargis Dallakyan
  • Website des Verlags:
  • http://mgltools.scripps.edu/Members/sargis
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 118.9 MB

Pyrx Stichworte


Pyrx Beschreibung

Sehen Sie sich molekulare Daten mit diesem Werkzeug an Pyrx ist eine einfach zu bedienende virtuelles Screening-Anwendung, die speziell für die Entdeckung von Wirkstoffe entwickelt wurde, die zur Bildschirmbibliotheken von Verbindungen gegen potenzielle Arzneimittelziele verwendet werden kann. Pyrx ermöglicht es, dass medizinische Chemiker virtuelles Screening-Formular für jede Plattform ausführen und den Benutzern in jedem Schritt dieses Prozesses hilft - von der Datenvorbereitung bis hin zur Vorlage und Analyse der Ergebnisse. Es stimmt zwar, dass im Drogenerfassungsvorgang kein Magic-Knopf gibt, enthält Pyrx Docking-Assistent mit einer benutzerfreundlichen Benutzeroberfläche, die es zu einem wertvollen Werkzeug für das computergestützte Drogendesign macht. Pyrx beinhaltet auch chemische Tabellenkalkulationstabellen-ähnliche Funktionalität und leistungsstarke Visualisierungsmotor, die für ein rationales Drogendesign unerlässlich ist. Was ist neu in dieser Version: · Save als Comma-separate Werte (CSV) -Tool für Datenbanktabellen hinzugefügt. · Empfehlungsfunktion für Datenbanktabellen hinzugefügt. Diese Funktion kann über eine Symbolleistenschaltfläche unter Tabellen-Registerkarte aufgerufen werden. Standardmäßig wird ein Tabellen-Plotting-Dialogfeld eröffnet, in dem ein Balkabrank der Bindungsenergie versus Ligand (Index) angezeigt wird. Wenn Sie einen PUBCHEM-Bioassay mit der offenen CVS-Taste geöffnet haben, prüft dieses Widget auch, ob es in diesem Tisch die Outome-Spalte gibt, und wenn ja . · Änderung des Standardkraftfelds für die Minimierung von Babel Energy von UFF bis MMFF94. · Geänderte Standardeinstellung für maximale Anzahl von Energieauswertungen (generischer Algorithmus-Parameter in Autodock) von Medium (GA_NUM_EVALS = 2500000) bis kurz (GA_NUM_VALS = 250000). · Automatischer PSBS-Vorlage-Fortschritts-Fortschritt hinzugefügt. · Ein Fehler behoben, der Probleme verursachte, wenn sie molekulare Oberflächen für angedockte Konformationen anzeigt. · Ein Dialogfeld hinzugefügt, um eine alternative Konformation auszuwählen, wenn die Makromoleküldatei (PDBQT) für Autodock hergestellt wird. · Aktiviert den Qualitätsagenten der Entdeckung, mit dem Fehlerbericht und Kommentare von einem Benutzer erhalten werden können. · CANCEL-Option für Autogrid-Webdienste hinzugefügt. · Implementierte flexible Rückstände für Autodock. Diese Funktion kann Zugriff durch Auswahl von Rückständen unter Navigator-> Molekülen und mit der rechten Maustaste auf sie sein. Wählen Sie Autodock -> flexible Rückstände, um _flex-Ordner unter Navigator zu erstellen -> Autodock -> Makromoleküle mit Rezeptor PDBQT und FLEX.PDBQT. Alle Andocken an diesen Rezeptor erfolgen dann mit diesen flexiblen Rückstand (en). · Python auf Version 2.6 und ETS auf 3.4.0 aktualisiert.


Pyrx Zugehörige Software