Pycogent. Frei- und Open-Source-Python-Sequenz-Toolkit
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Pycogent. Ranking & Zusammenfassung

Pycogent. Stichworte

Toolkit. Python-Toolkit. Sequenz-Toolkit. Python-Sequenz Reihenfolge Pycogent.

Pycogent. Beschreibung

Kostenlose und Open Source Python Sequenz Toolkit Pycogent ist ein Toolkit, um von der Reihenfolge sinnvoll zu machen. Pycogent enthält Anschlüsse in Remote-Datenbanken, Controller für 3RD-Anwendungen und integrierte verallgemeinerte probabilistische Techniken für die Arbeit mit biologischen Sequenzen. Anforderungen: · Python 2.5.1 oder höher · NUMPY 1.0 oder höher Was ist neu in dieser Version: · PYPI INSTALLIEREN Jetzt funktioniert, siehe Arbeit in Bug 2807542, 2807539 Cogent 1.2 - 1.3 Neue Funktionen · Python2.6 ist jetzt unterstützt · Cogent.cluster.nmds hinzugefügt, Code, um nichtmetrische multidimensionale Skalierung auszuführen. Nicht so schnell wie andere (z.: R, Massenpaket, Isoms) · Dokumentation, die mit dem SPHINX-Dokumentationsgenerator verwendet wird. · Hauptzusätze zur Dokumentation in doc / Beispielen. · Partielle Unterstützung zum Abfragen der ENSEMBL-MySQL-Datenbanken hinzugefügt. Diese Kapazität verfügt über zusätzliche Abhängigkeiten (MySQL-PYTHON und SQLALCHEMIE). Dieses Modul sollte als Alpha-Level-Code betrachtet werden (obwohl es seit einiger Zeit in den Händen der Entwickler zuverlässig funktioniert). · Einführung einer neuen Substitutionsmodellfamilie. Diese Familie hat die gleiche Form wie das ursprünglich von Muse und Gaut beschriebene Form.

Pycogent. Zugehörige Software