Peptideshaker Interpretation von Proteomics-Identifikationen aus mehreren Suchmaschinen
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Peptideshaker Ranking & Zusammenfassung

Peptideshaker Stichworte

Protein Identifikation

Peptideshaker Beschreibung

Der Peptideshaker ist eine freie Anwendung der freien und Open-Source-Anwendung, die die Visualisierung der Peptid- und Proteinidentifikationsergebnisse aus mehreren Suchmaschinen ermöglicht.Peptideshaker ist in acht Registerkarten unterteilt, die Aspekte der Analyse abdecken: · Überblick: Erhalten Sie einen einfachen, aber detaillierten Überblick über das Protein und das Peptid Identifikationen mit automatisch kommentierter Spektren und kommentierter Proteinsequenz. · Spektrum-IDs: Vergleich der Suchmaschinenleistung und erfahren Sie, wie die Suchmaschinenergebnisse kombiniert werden. · Fraktionen: Überprüfen Sie, aus welchen Fraktionen Proteinen und Peptiden wahrscheinlich kommen werden. · Änderungen: Erhalten Sie einen Überblick Von den post-translatorischen Modifikationen in der Datenmenge. · 3D-Struktur: Karten Sie die erfassten Peptide und Modifikationen an den entsprechenden PDB-Strukturen. · Anmerkung: Einfacher Zugriff auf Anmerkungsressourcen für Ihre Proteine. · Gehen Anreicherung: Anreicherte Go-Begriffe finden Sie in Ihrem Datensatz. · Validierung: Inspizieren und Feinabstimmen des Validierungsprozesses. · QC-PLATS: Erhalten Sie einen Überblick über die Qualität Ihrer Ergebnisse mit Qualitätskontrollen. Der Peptideshaker ist plattformübergreifend und es funktioniert auf Mac OS X, Windows und Linux. Binärdateien für Windows- und Linux-Plattformen sind auf der Homepage des Projekts verfügbar.

Peptideshaker Zugehörige Software