 | Padel-ADV.Kostenlose Software, um ein virtuelles Screening durchzuführen |
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Padel-ADV. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Yap Chun Wei
- Website des Verlags:
- http://padel.nus.edu.sg
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
- Dateigröße:
- 10.2 MB
Padel-ADV. Stichworte
Padel-ADV. Beschreibung
Kostenlose Software, um ein virtuelles Screening durchzuführen PADEL-ADV ist eine freie und einfach zu bedienende Java-Software, um ein virtuelles Screening mit Hilfe von Autodock Vina.before Running Padel-Adv durchzuführen, müssen Sie Folgendes durchführen: · Rezeptor-PDBQT-Datei mit AutodockTools vorbereiten. · Bereiten Sie Autodock Vina-Konfigurationsdatei auf Zumindest folgende Informationen (Kontrollkästchen Autodock Vina Manual für Beschreibung dieser Informationen) .a) receptorb) center_xc) center_yd) center_ze) size_xf) size_yg) size_z · Legen Sie alle Ligandendateien in einem Verzeichnis. Häufigste Dateiformate (z.B. MDL MOL, SMILES, PDB) und PDBQT-Dateien werden unterstützt. · RUN PADEL-ADV, Füllen Sie alle Felder aus und drücken Sie die Start-Taste. Bei der Fertigstellung wird für jeden Liganden eine ZIP-Datei mit Ergebnissen und zugehörigen Dateien erstellt. Die Ergebnisse aller Liganden werden in die angegebene CSV-Datei konsolidiert. Anforderungen: · Java 6 oder höher Was ist neu in dieser Version: · Ändern Sie die Art und Weise, wie der in der ZIP-Datei gespeicherte Ligand.pdb erzeugt wird, um RMSD-Berechnungen zu erleichtern.
Padel-ADV. Zugehörige Software
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