Oligocheck
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Oligocheck Ranking & Zusammenfassung

Oligocheck Stichworte

überprüfen Qualität Sonde Qualität überprüfen phylogenetische Sondenqualität Quality Checker.

Oligocheck Beschreibung

Software zum Überprüfen der Qualität von phylogenetischen Sonden und Primer-Sets Oligocheck ist eine Open-Source-Software zur Überprüfung der Qualität der phylogenetischen Sonden und der Primer-Sets.Die Fähigkeit von Nukleinsäurer-Primer-Sätzen und -sonden, ausschließlich auf die richtige Nukleinsäuresequenz zu binden, ist von grundlegender Bedeutung des genauen Targetings spezifischer phylogenetischer Gruppen. Eine solche Spezifität hängt weitgehend von der Einzigartigkeit des Bereichs der Nukleinsäuresequenz dieses Oligonukleotide-Ziels ab. Je ein einzigartiger der Region, desto robuster wird der Primer-Set oder die Sonde nur dann auf das beabsichtigte Ziel, auch wenn Variationen bei der Glühtemperatur und anderer biochemisch relevanter Parameter zu den Oligonukleotiden führen, die erfolgreich mit einem oder mehreren Basisunterschieden verbunden sind. Somit kann ein robuster Primer-Set oder eine Sonde als eins betrachtet werden, das ausschließlich auf das beabsichtigte Ziel annimmt, selbst wenn ein oder mehrere Nichtüberwachungen erlaubt sind Basis-Fehlanpassungen mit potenzieller Zielsequenz steigen. Der Benutzer liefert einen Primer-Set oder eine Sonde, um zusammen mit einer Datenbank mit Nukleinsäuresequenzen zu überprüfen. Oligocheck prüft den Primer-Set oder die Sonde mit jedem relevanten Datensatz in der Datenbank und notiert, ob die Übereinstimmungen mit einer zunehmenden Anzahl von Basisunternehmen zulässig sind. Die resultierende Analyse wird neben den Sequenzordnungsdaten in einer grafischen Form angezeigt. Anforderungen: · Java 1.4 oder höher

Oligocheck Zugehörige Software