Mesa Makro-evolutionäre Analyse und Simulationspaket
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Mesa Stichworte

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Mesa Beschreibung

Makro-evolutionäre Analyse und Simulationspaket Phygenies rauchen Waffen. Eine Evolutionsgeschichte tritt in ihrer Form die Fingerabdrücke jedes Prozesses, die ihre Erzeugung erwirbt haben: Aussterben, Schlüsselanpassungen, Strahlungen, Kolonisationen, Änderungen des Tempo und der Makroevolution. Die Analyse der Phyogenien ist leider schwierig. Die interessierenden Berechnungen für jeden Ermittler sind manchmal kompliziert und arbeitsintensiv. Sie sind auch häufig in mehreren Programmen, wenn überhaupt eine Software-Implementierung vorhanden ist. Die statistische Bedeutung der Ergebnisse erfordert häufig den Vergleich von Hunderten bis Tausenden von Bäumen. Schließlich können Metriken auf den Evolutionsmodus zerbrechlich sein, dass eine Phylogene untersteuert wird. Das Ergebnis dieser Probleme ist, dass phylogenetische Analyse oft harte Arbeit ist, und es ist schwer zu wissen, was Sie von den Antworten machen sollen. MESA ist eine Softwareanwendung, die erstellt wurde, um diese Probleme zu lindern. Obwohl MESA wirklich nur vier Dinge tätigt, ist der große Win für seine Benutzer, dass alle diese in einem Softwarepaket sind und in Verbindung miteinander eingesetzt werden können, und halbautomatisch, die Probleme der Übertragung von Daten zwischen Programmen und möglicher Korruption Oder FehlintEPretation der Ergebnisse werden vermieden Hier sind einige wichtige Funktionen von "Mesa": Manipulationen: · MESA ermöglicht es Datasets, auf raffinierte Weise manipuliert zu werden. Phylogenetische Bäume und Lebensgeschichte Merkmale können bearbeitet, dupliziert oder gelöscht werden. Branchenlängen können systematisch modifiziert werden, Taxa wird nach komplexen Bedingungen gelöscht, um globale und selektive Merkmale geändert. Das gesamte Dataset kann jederzeit auch gesichert und wiederhergestellt werden. Analyse: · MESA beinhaltet eine große Anzahl von Berechnungen, die die Vielfalt innerhalb einer Phylogenie (z. B. phylogenetische Vielfalt), Vielfalt in den Gemeinden (z. B. Shannon-Weiner-Index), Maskus des makrovolutionären Prozesses (z. B. Fusco-Cronk-Ungleichanz), analysieren können (z. B. Fusco-Cronk-Ungleichanz), und Informationen selektiv über die Taxa sammeln . Simulationen: · MESA ermöglicht es Phyogenien, unter ausgereiften Szenarien anzunehmen, in denen Speziation- und Extinktionsraten durch die Merkmale der beteiligten Taxa oder den globalen Attributen der Phylogenie erfolgen können. Simulationen können weiter mit Massenaussterben und der Entwicklung der Lebensgeschichte Merkmale weiter geschmückt werden. Automatisierung: · Um die Herstellung und Prüfung einer großen Anzahl von Phylogenies zu ermöglichen, lässt MESA den Benutzern Ketten von Aktionen (Manipulationen, Analysen und Simulationen) erstellen, die als einzelne Einheit ausgeführt werden können, die über Gruppen von Befehlen, Speichern und Wiederherstellen von Daten einsparten, speichern und wiederherstellen. Somit kann man leicht den Test einer großen Anzahl von Replikaten für die statistische Gültigkeit erstellen. Was ist neu in dieser Version: · Für dunkle technische Gründe (Zeilenendungen und Lesemodi) würde die PC-Version von MESA ablehnen, einige Dateien zu lesen, die auf dem Mac fein gelesen wurden. Es scheint jetzt repariert zu sein. Dank Henri zum Erkennen dieses Problems.

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