Mauve

konstruiert globale Mehrfachausrichtungen von umgebenden Genomsequenzen
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Mauve Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Aaron Darling
  • Website des Verlags:
  • http://genome-alignment.org/mauve/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X 10.3 or later
  • Dateigröße:
  • 14.2 MB

Mauve Stichworte


Mauve Beschreibung

Konstruiert globale Mehrfachausrichtungen an umgebenden Genomsequenzen MAUVE ist ein System, um mehrere Genomausrichtungen in Gegenwart großer evolutionärer Ereignisse wie Umrüstung und Inversion effizient zu errichten. Multiple Genome-Ausrichtung bietet eine Grundlage für die Erforschung vergleichender Genomik und das Studium der evolutionären Dynamik in einem neuen Maßstab. Die Ausrichtung der gesamten Genome ist ein grundsätzlich anderes Problem als ein Ausrichten von kurzen Sequenzen.MAUVE wurde mit der Idee entwickelt, dass ein Multiple Genome-Aligner nur bescheidene Rechenressourcen erfordern sollte. Mauve beschäftigt algorithmische Techniken, die in der Menge der ausgerichteten Sequenz skaliert werden Was ist neu in dieser Version: Neue Eigenschaften: · Kompatibilität mit älteren Versionen von Mac OS X Fehler behoben: · Der SNP-Ausgang hält jetzt gemischte Gehäuse-Sequenzdateien und Lückenzeichen · Die Nutzung des Aligner-Speichers wurde gestrafft, was zu reduzierten Speicheranforderungen für Ausrichtungen mit vielen Genomen führt · Fix für den Fehler, der verhindert, dass die Genom-Format-Genomen auf der Befehlszeile neu ordnet · Fixierter Absturz beim Erzeugen von Müttern · Melden Sie einen Fehler, wenn Sequenzen, die Lücken enthalten, als Eingabe verwendet werden · Entfernen Sie zusätzliche Neulinien in der OriTHOLOG-Ausrichtungsausgabe · Behoben ein OpenJDK-Rechteck-Zeichenfehler


Mauve Zugehörige Software