Masqot-Gui.

Kostenlose und offene Quellqualitätskontrolle
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Masqot-Gui. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • LGPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Max Bylesj
  • Website des Verlags:
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 1.7 MB

Masqot-Gui. Stichworte


Masqot-Gui. Beschreibung

Kostenlose und offene Quellqualitätskontrolle Masqot-GUI bietet eine plattformunabhängige Software-Pipeline mit offener, plattformunabhängiger Software-Pipeline für zweikanalige Microarray-Spot-Qualitätskontrolle. Die Masqot-GUI umfasst Segmentierung, Quantifizierung, Rüstung, Qualitätsbewertung und Datenvisualisierung.masqot-gui Hosts drei unabhängige Anwendungen (Masqotgrid, Masqotseg und MasqotView) zu diesem Zweck mit Wechselwirkungen zwischen den Tools sowie der Import- und Exportunterstützung für externe Software.masqotgrid ist ein Antrag auf Rätsel (Adressierung) von zwei-Kanal-Microarray Data.masqotseg ist ein Antrag auf Segmentierung von Microarray-Spots mit integrierter Multivariate-Spot-Qualitätskontrollbewertung. Das Programm verwendet Spotorte (von MASQOTGRID oder aus anderen Rüstungsanwendungen) und gibt eine Reihe von Common-Spot-Eigenschaften zusammen mit der MasqOT-Qualitätswertung aus. MasqotView ist ein Antrag zum Anzeigen und Fixieren von Microarray-Flecken. Ausgewählte Flecken, filtriert, basierend auf der MasqOT-Qualitätssteuerung, werden abgeschnitten und skaliert und können anschließend visuell inspiziert werden. Anforderungen: · Java Was ist neu in dieser Version: · Masqot-GUI: Hinzugefügte Hinweise auf die Bioinformatik-Anwendungen Notizpublikation. · MasoqtView: Spot-Sortierreihenfolge ist jetzt standardmäßig 'QC' '. · MasqotView: Die Schaltfläche "Aus der Liste entfernen" hinterlassen nicht mehr ausgewählte Einträge mehr aufgrund eines vorherigen Implementierungsfehlers. · MasqotView: Abmessungen des Informationsfensters (wenn der Center-Knopf mit dem Anklicken eines Spots) leicht erhöht wurde. · MASQOTSEG: Der Indikator "Gesamtfortschritt" wurde behoben. · Masqotseg: Die Breite des Bearbeitungsdialogs wird nun von der Breite des Hauptfensters bestimmt. · MASQOTSEG: Die Schaltfläche "Aus der Liste entfernen" hinterlassen nicht mehr ausgewählte Einträge mehr aufgrund eines vorherigen Implementierungsfehlers. · MASQOTSEG: Die Liste der generierten Dateien wurde korrigiert (enthält nicht mehr nur die generierten Dateien aus dem letzten der verarbeiteten Gitter in der Liste). · MASQOTSEG: Jetzt möglich, um HINTERGRUND (BG) miteinander verbundene Probleme zu ignorieren, indem Sie das Kontrollkästchen "BG-Kontaminants ignorieren" überprüfen.


Masqot-Gui. Zugehörige Software

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