Maexplorer. maexplorer - Java-basierte Datenbergbaueinrichtung für cDNA- oder Oligonucleiotide-Microarray-Datenbanken
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Maexplorer. Ranking & Zusammenfassung

Maexplorer. Stichworte

Datengräber Gen cDNA cDNA-Datenminer Genvergleich. Genanalyse

Maexplorer. Beschreibung

MAEXPLORER - Java-basierte Daten-Mining-Fazilität für cDNA- oder Oligonukleiotid-Microarray-Datenbanken Maexplorer (Microarray Explorer) ist eine Java-basierte Data-Mining-Fazilität für cDNA- oder Oligonucleiotide-Microarray-Datenbanken. Die Umgebungsumgebung der Erkundungsdatenanalyse bietet Werkzeuge für den Datenabbau von quantitativen Expressionsprofilen über mehrere Microarrays.MicroArray-Daten können in Array-Pseudoimages, Scatter-Parzellen, Histogramme, Expressionsprofil-Parzellen, Clusteranalysen (ähnliche Gene, k-Mittel, direkt angesehen und direkt manipuliert werden oder K-Median, hierarchisches Clustering usw.) und Berichte. Ein wichtiges Merkmal ist die GEN-Datenfilter zum Einschränken eines Arbeitssatzes von Genen an diejenigen, die eine Vielzahl von benutzerfördernden Tests und -bedingungen bestehen. Berichte können mit Hypertext-Webzugriff auf genomische Datenbanken wie Unichene, Locuslink, DBEST, NCI / CIT MADB Microarray-Datenbank, Bild, GenBank und andere Internet-Datenbanken für Sets von Genen, die festgestellt wurden, dass sie von Interesse waren. Ein wichtiger Fokus dieses Tools ist interaktives Data-Mining mit Zugriff auf andere unterstützende Web-Genom-Datenbanken. Der Schwerpunkt auf die direkte Manipulation von Genen und GENE-Sets in Grafiken und Tabellen bietet ein hohes Maß an Interaktion mit den Daten, die es den Ermittlern erleichtern, Ideen beim Ansehen von Mustern zu testen. Der Maexplorer Open Java API steht zur Verfügung, um Ihre eigenen Java-Maeklugine zu erstellen . Auf diese Weise können Sie Ihre eigenen analytischen Tools sowie die von anderen Forschern erstellten Analysen hinzufügen, um die MAExplorer-Funktionalität zu erweitern. Diese könnten das Hinzufügen neuer Analysemethoden an das Basissystem wie statistische Tests, Normalisierung, Clustering, Client-Server usw. umfassen usw. all einige wichtigen Funktionen von "maexplorer": · Analysieren der Expression einzelner Gene; · Analysieren Sie den Ausdruck von Genfamilien und -clustern; · Vergleichen Sie Expressionsmuster und Ausreißer; · Zugriff direkt auf andere genomische Datenbanken für Zinssätze.Nache: MAEXPLORER wird unter der Publikum Mozilla-Lizenz 1.1 (MPL 1.1) veröffentlicht.

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