LOCOMOTIF. Software zur Lokalisierung von RNA-Motiven
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LOCOMOTIF. Ranking & Zusammenfassung

LOCOMOTIF. Stichworte

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LOCOMOTIF. Beschreibung

Software zur Lokalisierung von RNA-Motiven LOCOMOTIF ist eine kostenlose Software, die für die Lokalisierung von RNA-Motiven mit generierten thermodynamischen Matchern verwendet werden kann.locomotif ist ein GUI-basiertes Programm, das das visuelle Design von RNA-Motiven ermöglicht. Die grafischen Strukturen werden dann in ausführbare Programme übersetzt, die zum Suchen eines Motivs in einem Sequenz (Klartext oder FASTA-Format) verwendet werden. Konstruieren Sie eine fertige Struktur (mit nur den offenen 5'- und 3'-Enden): · Verwenden Sie die linken Tasten mit Wählen Sie einen Baustein. Platzieren Sie den ersten Baustein auf der Leinwand mit einem Mausklick. Fügen Sie anschließende offene offene Enden nacheinander hinzu oder verwenden Sie sie, um neue Strukturteile zu starten. · Einzelne Stränge können nur in geschlossenen Strukturen mit nur einem offenen Ende nach links pro Strukturteil verwendet werden. Dann können sie verwendet werden, um das Ende des 5 'oder 3' zu verlängern oder eine dieser mit unterschiedlichen Strukturteilen zu verbinden. · Verwenden Sie die oberen Tasten zum Bearbeiten von Operationen an der MotiF.matcher-Generierung: · Verwenden des Menüs "Übersetzung -> Senden XML ", senden Sie den XML-Code an unseren Server für die Übersetzung auf dem Server. Sie erhalten eine Bibiserv-ID, wenn die Kompilierung abgeschlossen ist. Dies kann einige Zeit dauern! Ausführen des Matchers: · Sie können das generierte Matcher-Programm direkt über LOCOMOTIF mithilfe des Menüs "Führen Sie Matcher-> Sequenz" ausführen. Alternativ können Sie die Submissionsseite zusammen mit der erhaltenen ID verwenden. · Geben Sie eine Sequenz in Klartext oder Fasta-Format an und laden Sie sie auf den Server hoch. · · · Die Ergebnisse werden Ihnen entweder in der Lokomotif oder in einer Webseite vorgelegt, abhängig von Ihrer Einreichung der Einreichung. Anforderungen: · Java 1.2.2 oder höher

LOCOMOTIF. Zugehörige Software