 | JMOTU. |
| Jetzt downloaden | |
JMOTU. Ranking & Zusammenfassung
Anzeige
- Lizenz:
- Freeware
- Name des Herausgebers:
- Mark Blaxter
- Website des Verlags:
- http://www.nematodes.org/
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
- Dateigröße:
- 7.5 MB
JMOTU. Stichworte
JMOTU. Beschreibung
Software zum Clustering-Barcode-DNA-Sequenzdaten in molekulare operative taxonomische Einheiten (Motu) JMOTU ist ein kostenloses, einfach zu bedienendes Softwarepaket für Clustering-Barcode-DNA-Sequenzdaten in molekulare operative taxonomische Einheiten (Motu). JMOTU kann große Datensätze verarbeiten und verwenden eine Reihe von Filterschritten, um die Anzahl der exakten globalen Ausrichtungen zu minimieren, die ausgeführt werden müssen. Bei der Berechnung der paarweiten Entfernungen ignoriert JMOTU Lücken und zählt nur Nukleotid-Mis-Matches, wodurch es relativ robust ist, um Sequenzierungsfehler, die durch Homopolymerläufe verursacht werden, relativ robust, um zu streichen. Das Clustering wird mit einem gierigen Algorithmus durchgeführt, der nicht von der Eingabesequenzreihenfolge abhängig ist. JMOTU wurde auf Rohdatensätzen von rund 50.000 Eingangssequenzen getestet und können größere Datensätze angreif, indem sie ein Formular von Untermengen von Daten vorformen, bevor sie für eine globale Analyse kombiniert werden.
JMOTU. Zugehörige Software
