Haplogenemapper

Open Source-Visualizer für die genomische Nähe von hapoinfizierenden Genen zu segmentalen Vervielfältigungen
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Haplogenemapper Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • HaploGeneMapper Team
  • Website des Verlags:
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 40 KB

Haplogenemapper Stichworte


Haplogenemapper Beschreibung

Open Source-Visualizer für die genomische Nähe von Haploversügen genügend Gene zu segmentalen Vervielfältigungen HAPLOGEREMAPPER ist ein freies und offenes Quellwerkzeug, das aufgebaut ist, um die genomische Nähe von hapoinfessionellen Genen an Segmentvisiten auf ACHROMOSOME-BY-CHROMOSOME-Basis zu visualisieren. Entsprechende Paare von segmentalen Vervielfältigungen, die einer nicht allelizierten homologen Rekombination unterliegen können, können mit der Mauszeiger. In ähnlicher Weise können die Namen der HapoInfouSuch-Gene und der segmentalen Duplikationen angezeigt werden, indem der Cursor über sie schwächt wird. Bei Bedarf kann der Benutzer in einen Abschnitt des ausgewählten Chromosoms vergrößern, indem die Start- und Endkoordinaten des gewünschten Bereichs bereitgestellt werden. Hier sind einige wichtige Funktionen von "Hapogenemapper": · Bunte, klare und anpassbare Visualisierung von Merkmalen auf einem oder mehreren Chromosomen gleichzeitig. · Vergrößern Sie einen beliebigen Teil des Chromosoms. · Sehr einfaches Eingabeformat. Skripts werden zur Erstellung von Eingabedateien aus regulären Listen von Genen oder Segmentvisiten in Textdateien bereitgestellt. · Hohe Flexibilität: Obwohl ursprünglich entwickelt wurde, um hapoinfizierende Gene und segmentale Vervielfältigungen anzuzeigen, kann es verwendet werden, um alle Funktionen mit interessanten räumlichen Beziehungen innerhalb eines Genoms darzustellen. Anforderungen: · Java 1.6 oder höher


Haplogenemapper Zugehörige Software

Pyreport

ein Programm, das ein Python-Skript ausführt und seine Ausgabe erfasst und ihn in einem hübschen Bericht in einem PDF- oder einer HTML-Datei kompiliert ...

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