Go-elite. Anwendungs-Open-Source-Anwendungen für die erweiterte Pfadanalyse
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Go-elite. Ranking & Zusammenfassung

Go-elite. Stichworte

identifizieren GEHEN

Go-elite. Beschreibung

Go-Elite ist ein Software-Tool, das zum Identifizieren eines minimalen nicht redundanten Satzes von Gene-Ontologie (GO) -Biologik oder Wege, um einen bestimmten Satz von Genen zu ermitteln. Zusätzlich können alternative Ontologien (z. B. Krankheits-Ontologie), Metabolomendaten- und Gensätze verwendet und auch als Input verwendet werden. Dieses Werkzeug berechnet Über-Repräsentationsstatistiken, die dem PC-Programm Mappfinder ähnlich sind, und erzeugt anschließend gefilterte GO und Wege-Ergebnisse zusammen mit entsprechenden Gen-Anmerkungen und zusammengefasste Ausdrucksdaten. Go-Elite-Version 1 wird als eigenständige Anmeldung für den Mac und PC sowie als plattformübergreifender Quellcode in Python bereitgestellt. Diese Software kann über eine intuitive grafische Benutzeroberfläche über Befehlszeilenflags oder von WebService ausgeführt werden. Der Webservice ist über eine Website, programmgesteuert oder mit dem Go-Elite-Plugin in CytsScape zugänglich. Detaillierte Anweisungen zum Installieren und Verwenden des Go-Elite-Dienstprogramms auf Ihrem Mac sind hier verfügbar.

Go-elite. Zugehörige Software