Garli.

Phylogenetische Analyse molekularer Sequenzdaten mit dem Maximum-Wahrscheinlichkeitskriterium
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Garli. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Derrick Zwickl
  • Website des Verlags:
  • http://code.google.com/u/dzwickl/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 2.1 MB

Garli. Stichworte


Garli. Beschreibung

Phylogenetische Analyse molekularer Sequenzdaten mit dem Maximum-Wahrscheinlichkeitskriterium Garli steht für einen genetischen Algorithmus für schnelles phylogenetische Inferenz und ist im Wesentlichen ein Programm zum Inferrieren von phylogenetischen Bäumen. Garli verwendet einen Ansatz, der einem klassischen genetischen Algorithmus ähnlich ist, so dass er den Raum von evolutionären Bäumen und Modellparametern schnell durchsuchen kann, um die Lösung zu finden, um die Wahrscheinlichkeitswertung zu maximieren. Garli implementiert Nukleotid-, Aminosäure- und Codon-basierte Modelle der Sequenzentwicklung und läuft auf allen Plattformen.


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