Flagdb ++. Integrative Datenbank um Pflanzengenome
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Flagdb ++. Beschreibung

Integrative Datenbank um Pflanzengenome FLAGDB ++ ist ein kostenloser Pflanzengenom-Viewer, der in der Java-Programmiersprache geschrieben wurde. Die Genome der Modellanlagen werden als physische Referenzen verwendet, um alle erzeugten Informationen zu sammeln und zusammenzuführen, um funktionale Vorhersagen zu optimieren. In der Tat erfordert die biologische Interpretation großer Datenmengen ihre Integration, Organisation und visuelle Vertretung. Die Organisation der Daten um die Chromosomensequenzen ermöglicht es, die Redundanz der Informationen und Referenzen zu reduzieren, sondern auch, um die Konzepte der Synteny- und Genomentwicklung und die Beziehungen zwischen der Struktur und der Funktion der Gene leicht zu studieren. Nur mit dieser allgemeinen Übersicht, dass die Funktionsstudie von Genen und der Orthologie-Quest möglich ist, unter Berücksichtigung von Muster der Regulierung und Rollen und Beziehungen von Genen in bestimmten physiologischen Staaten. Daher ist das ultimative Ziel dieses Projekts, eine Datenbank und assoziierte Bioinformatik-Tools auf der Grundlage der Integration genomischer Daten um eine Auswahl von Anlagen vollständigen Genomen zu entwickeln. Anforderungen: · Java 1.4 oder höher Was ist neu in dieser Version: · Aktualisierung von Arabidopsis und Reisgenomen und deren Annotation · Integration von Vitis 12x Genom und Annotation · Eugene Annotation des Vitis-Genoms · Integration von phylogenetischen Profilen · New Arabidopsis FST und GST · Aktualisierung aller Transkriptionsressourcen (EST und cDNA) · Integration von vorhergesagten arabidopsis smallrna · Neue Tools und Schnittstellen für orthologische Beziehungen · Aktualisierung der subzellulären Lokalisierung, Genefamilie und Querverweise

Flagdb ++. Zugehörige Software