Edinburgh Pathway Editor.ein kostenloser visueller Editor für die Anmerkung, Visualisierung und Präsentation der großen Auswahl an biologischen Netzwerken | |
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Edinburgh Pathway Editor. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Edinburgh Pathway Editor Team
- Website des Verlags:
- http://www.bioinformatics.ed.ac.uk/epe/
- Betriebssysteme:
- Mac OS X 10.4 or later
- Dateigröße:
- 143 MB
Edinburgh Pathway Editor. Stichworte
Edinburgh Pathway Editor. Beschreibung
Ein kostenloser visueller Editor für die Anmerkung, Visualisierung und Präsentation der großen Auswahl an biologischen Netzwerken Der Edinburgh Pathway Editor ist ein freier und einfach zu bedienender visueller Editor, der für Anmerkung, Visualisierung und Präsentation der großen Auswahl an biologischen Netzwerken entwickelt wurde, einschließlich metabolischer, genetischer und Signaltransduktionspfade. Der Edinburgh Pathway Editor basiert auf einer metadatengetriebenen Architektur, die es sehr flexibel macht, Informationen in Bezug auf das interessierende Netzwerk in Bezug auf Zeichnen, Lagerung, Präsentieren und Exportieren von Informationen. Das Edinburgh Pathway Editor ermöglicht die visuelle Vertretung an Feldstandards (SBGN), Speicherung und Abruf der Annotation, z. B. kinetischen und anderen numerischen Daten in relationalen Datenbanken (lokal und ferner für die Enterprise-Entwicklung) und verknüpft grafische Objekte in externen Datenbanken und Webressourcen, um alle verfügbaren verfügbaren Datenbanken zu erhalten Informationen zu Demand.edinburgh-Pathway-Editors Eine kleine Anzahl von Grundobjekten, um Hauptkonzepte des biologischen Netzwerks darzustellen. "Form" stellt das biologische Objekt oder das Subsystem dar, das als "A Black Box" mit der Anzahl der mit ihm verbundenen Ports behandelt wird. Prozess visualisiert Sequenzen von Ereignissen, z. eine biochemische Reaktions- oder Protein-Interaktion. Link wird verwendet, um eine beliebige pair-weise Beziehung zwischen Objekten darzustellen, einschließlich "Identität" oder "Akt auf" Beziehungen. Label ist ein visuelles Objekt, um Textinformationen darzustellen und Links zu anderen Karten und Ressourcen zuzulassen. Der Edinburgh-Pathway-Editorconcept von "Context" trennt Metadaten- und visuelle Standards von Wegkarten und Pfaddaten. Es ermöglicht den Einstellen der "Zeichnungspalette" für die ausgewählte Karte. Mit dem Kontext könnte man ein neues Objekt mit speziellen kundenspezifischen Eigenschaften erstellen. Der Kontext ist eine Sammlung von Objekten, ihrer Eigenschaften und ihrer Standardwerte. Der Kontext ermöglicht es dem Benutzer, neue Objekte auf der Grundlage vorhandener Ergebnisse zu erstellen. Der Kontextimmobilien-Editor bietet eine große Flexibilität bei der Beschreibung der Speicherstandards und der visuellen Präsentation. Anforderungen: · 500 MB freier Speicherplatz Was ist neu in dieser Version: · Unterstützung für SBGN-Notationskarten. · Export der metabolischen Notation in SBML, Excel und Biopax · Verbesserte, robustere Bearbeitungsfunktionen.
Edinburgh Pathway Editor. Zugehörige Software
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