ComplassEcompositionVectorcli. Eine terminalbasierte App zur Genotypisierung über komplette Zusammensetzungsvektoren und MapReduce
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ComplassEcompositionVectorcli. Ranking & Zusammenfassung

ComplassEcompositionVectorcli. Stichworte

Vektor Karte verkleinern ccv.

ComplassEcompositionVectorcli. Beschreibung

Der klassische Genotyping-Ansatz basiert auf der phylogenetischen Analyse, beginnend mit einer Mehrfachsequenzausrichtung. Genotypen werden dann von der fachkundigen Untersuchung von phylogenetischen Bäumen festgelegt. Solche Methoden sind jedoch suboptimal für ein schnell wachsendes Dataset, da sie einen erheblichen menschlichen Anstrengungen erfordern, und weil sie mit der Anzahl der Sequenzen schnell in der Rechenkomplexität ansteigen. COMPOLALECOMPOSITIONVECTORCLI verwendet ein Verfahren zur Genotypisierung, das unabhängig von mehreren Sequenz-Alignment.comPletEcompositionVectionCli ist, um den gesamten Zusammensetzungsvektoralgorithmus zu verbrauchen, um jede Sequenz in der Datenmenge als einen von seinen Bestandteil der Bestandteile abgeleiteten Vektor darzustellen, und Affinitätsausbreitung Clustering, um die Sequenzen in Genotypen zu gruppieren basierend auf einem Entfernungsmaß an den Vektoren. Unsere Methoden produzieren Ergebnisse, die gut mit fachkundig definierten Körnern oder Genotypen korrelieren, zu einem Bruchteil der Rechenkosten traditioneller phylogenetischer Methoden. Detaillierte Anweisungen zur Installation und Verwendung des CompuleCompositionVectorCli-Dienstprogramms auf Ihrem Mac sind hier verfügbar.

ComplassEcompositionVectorcli. Zugehörige Software