CodonCode Aligner

Eine großartige Anwendung für Sequenzbaugruppe, Bearbeitungs- und Mutationserkennung
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CodonCode Aligner Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Trial
  • Preis:
  • USD 960.00 | BUY the full version
  • Name des Herausgebers:
  • CodonCode Corporation
  • Website des Verlags:
  • http://www.codoncode.com/index.htm
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X 10.3.4 or later
  • Dateigröße:
  • 21.1 MB

CodonCode Aligner Stichworte


CodonCode Aligner Beschreibung

Eine großartige Anwendung für Sequenzbaugruppe, Contig-Bearbeitungs- und Mutationserkennung CodonCode Aligner ist ein Programm für Sequenzbaugruppe, Contig-Bearbeitung und Mutationserkennung, verfügbar für Windows und Mac OS X. ALIGNER ist mit PHED-PHRAP kompatibel und unterstützt die Quality-Scores von Sequence-Qualität, während Sie eine vertraute, leicht lernen Benutzeroberfläche anbieten Mit dem .codoncode-Aligner können Sie moderne Algorithmen für die Base-Calling- und Sequenzbaugruppe voll nutzen, ohne dass Sie komplizierte Befehlszeilenoptionen oder Perl-Programmierung erlernen. Hier sind einige wichtige Funktionen von "CodonCode Aligner": · Importieren Sie Sequenzen aus Textdateien. · Importieren Sie Sequenzen aus ABI- und SCF-Dateien. · Endclip · Vektorbesatz. · Zusammenwirken von Contigs. · Richten Sie an einer Referenzsequenz aus. · Malen Sie CONSTIGS miteinander aus, während Sie die Links zu den Spuren halten. · Montieren oder in Gruppen anbauen, basierend auf Beispielnamen. · Finden Sie heterozygote Mutationen. · Heterozygote Einfügungen und Löschungen analysieren. · Definieren von Interessenregionen ("Funktionen"), beispielsweise mit niedrigem Qualitätskonsensionsbereich. · Navigieren Sie schnell zwischen benutzerdefinierten Funktionen. · Importieren und bearbeiten Sie PHRAP-erzeugte Baugruppen. · Führen Sie PHED und PHRAP direkt aus Aligner-Projekten aus. · Sie haben auch die Möglichkeit, Funktionen und Sequenzen zu exportieren. · Export-kompatible Montageprojekte exportieren. Einschränkungen: · 30 Tage Probezeit. · Sie können in Ihren Projekten nur nicht zusammengebaute Proben verwenden. · Sie können auch nicht speichern, exportieren oder drucken, von Projekten, die CONSTIGS enthalten, oder nachdem Sie eine der eingeschränkten Funktionen ausprobiert haben (Aligner wird Sie zuerst warnen). Was ist neu in dieser Version: · Aminosäure-Übersetzung für alle Proben. · Hintergrundfarben basierende Protein-Übersetzungsbasis. · Differenztabellen. · Direkt von der Genbank importieren. · Skriptmenü. · Neue Skriptbefehle. · Importieren Sie 454 Daten (SFF-Dateien). · Erstellen Sie neue Textabläufe. · Unterstütze größere Projekte. · Schnellere Baugruppen. · Automatische Speicherung bei Windows. · Verbesserte Stift-Tablet-Unterstützung.


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