Ccdeep. CHROMATIN-Konformation Deep-Analyse
Jetzt downloaden

Ccdeep. Ranking & Zusammenfassung

Ccdeep. Stichworte

analysieren Konformation

Ccdeep. Beschreibung

Mit dem Tool Chromatin Conformation Deept Analysis (CCDEEP) können Sie die Chromatin-Konformations-Sequenzierungsdaten von HI-C-Experimenten analysieren. CCDEEP kann die Daten auf der Grundlage mehrerer Faktoren verarbeiten: · Filtert Sequenzen mit niedriger Qualität, basierend auf ihrer fernen Abbildung von der ausgewählten Restriktionsenzymstelle oder deren Befestigung an Regionen mit geringer Mappelabilität · Erzeugt eine Aufzählung und Quantifizierung (roh und normalisiert) von Paaren von Fragmentenden · Fasst die Visualisierung der vorgespannten Quantifizierung (GC-Inhalt, Fragmentlänge und -hilfbarkeit) zusammen. Detaillierte Anweisungen zum Installieren und Verwenden des CCDEEP-Dienstprogramms auf Ihrem Mac sind hier verfügbar. CCDeep ist plattformübergreifend und es funktioniert auf dem Mac OS X und Linux. Binaries für die Linux-Plattform sind auf der Homepage des Projekts verfügbar.

Ccdeep. Zugehörige Software