Carmaweb. Eine Webanwendung für die Analyse von Micro-Array-Daten
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Carmaweb. Ranking & Zusammenfassung

Carmaweb. Stichworte

analysieren Microarray Clusteranalyse Micro-Array-Analyse Gene erkennen. Micro-Array

Carmaweb. Beschreibung

Eine Webanwendung, die für die Analyse von Micro-Array-Daten entwickelt wurde Die Carmaweb ist die Abkürzung für den "umfassenden R-basierten Microarray-Analyse-Webservice". Carmaweb führt die Datenvorverarbeitung (Hintergrundkorrektur, Qualitätskontrolle, Normalisierung), Erkennung differentiell exprimierter Gene, Clusteranalyse, Dimensionsreduzierung und -visualisierung, Klassifizierung und Gene-Ontologie-Termanalyse durch. Diese Webanwendung akzeptiert Rohdaten aus einer Vielzahl von Imaging-Softwaretools Für die am häufigsten verwendeten Microarray-Plattformen: Affymetrix-GenechiPs, beschmutzte zweifarbige Microarrays und angewandte Biosysteme (ABI) Microarrays. R und Pakete aus dem Biokonduktorprojekt werden als analytischer Motor verwendet. Die Webanwendung ist in Java basierend auf der neuesten J2EE-Softwaretechnologie von J2EE (Java 2 Enterprise Edition) implementiert. Anforderungen: · Java Was ist neu in dieser Version: · Neue Analysen werden nach 66 Tagen automatisch gelöscht · Symbol Neue herunterladbare Version von Carmaweb (1.0.8) mit Unterstützung für R 2.3 und BioConductor 1.8

Carmaweb. Zugehörige Software